Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWZ7

ABRAXAS1, BRCA1-A complex subunit Abraxas 1, humanhuman

Predictions only

Length 409 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABRAXAS1Q6UWZ7 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ABRAXAS1Q6UWZ7 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ABRAXAS1Q6UWZ7 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ABRAXAS1Q6UWZ7 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ABRAXAS1Q6UWZ7 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.82
ABRAXAS1Q6UWZ7 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
ABRAXAS1Q6UWZ7 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ABRAXAS1Q6UWZ7 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ABRAXAS1Q6UWZ7 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ABRAXAS1Q6UWZ7 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ABRAXAS1Q6UWZ7 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ABRAXAS1Q6UWZ7 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ABRAXAS1Q6UWZ7 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ABRAXAS1Q6UWZ7 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ABRAXAS1Q6UWZ7 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ABRAXAS1Q6UWZ7 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ABRAXAS1Q6UWZ7 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ABRAXAS1Q6UWZ7 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ABRAXAS1Q6UWZ7 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ABRAXAS1Q6UWZ7 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ABRAXAS1Q6UWZ7 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ABRAXAS1Q6UWZ7 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ABRAXAS1Q6UWZ7 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ABRAXAS1Q6UWZ7 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ABRAXAS1Q6UWZ7 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ABRAXAS1Q6UWZ7 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ABRAXAS1Q6UWZ7 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ABRAXAS1Q6UWZ7 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ABRAXAS1Q6UWZ7 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ABRAXAS1Q6UWZ7 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ABRAXAS1Q6UWZ7 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ABRAXAS1Q6UWZ7 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ABRAXAS1Q6UWZ7 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ABRAXAS1Q6UWZ7 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ABRAXAS1Q6UWZ7 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ABRAXAS1Q6UWZ7 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ABRAXAS1Q6UWZ7 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ABRAXAS1Q6UWZ7 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ABRAXAS1Q6UWZ7 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
ABRAXAS1Q6UWZ7 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ABRAXAS1Q6UWZ7 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ABRAXAS1Q6UWZ7 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ABRAXAS1Q6UWZ7 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
ABRAXAS1Q6UWZ7 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
ABRAXAS1Q6UWZ7 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ABRAXAS1Q6UWZ7 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ABRAXAS1Q6UWZ7 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ABRAXAS1Q6UWZ7 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ABRAXAS1Q6UWZ7 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ABRAXAS1Q6UWZ7 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ABRAXAS1Q6UWZ7 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ABRAXAS1Q6UWZ7 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ABRAXAS1Q6UWZ7 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ABRAXAS1Q6UWZ7 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ABRAXAS1Q6UWZ7 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ABRAXAS1Q6UWZ7 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ABRAXAS1Q6UWZ7 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ABRAXAS1Q6UWZ7 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
ABRAXAS1Q6UWZ7 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ABRAXAS1Q6UWZ7 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ABRAXAS1Q6UWZ7 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ABRAXAS1Q6UWZ7 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ABRAXAS1Q6UWZ7 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ABRAXAS1Q6UWZ7 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ABRAXAS1Q6UWZ7 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ABRAXAS1Q6UWZ7 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ABRAXAS1Q6UWZ7 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ABRAXAS1Q6UWZ7 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ABRAXAS1Q6UWZ7 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ABRAXAS1Q6UWZ7 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ABRAXAS1Q6UWZ7 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ABRAXAS1Q6UWZ7 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ABRAXAS1Q6UWZ7 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ABRAXAS1Q6UWZ7 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ABRAXAS1Q6UWZ7 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ABRAXAS1Q6UWZ7 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ABRAXAS1Q6UWZ7 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ABRAXAS1Q6UWZ7 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ABRAXAS1Q6UWZ7 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ABRAXAS1Q6UWZ7 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ABRAXAS1Q6UWZ7 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ABRAXAS1Q6UWZ7 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ABRAXAS1Q6UWZ7 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ABRAXAS1Q6UWZ7 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ABRAXAS1Q6UWZ7 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ABRAXAS1Q6UWZ7 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ABRAXAS1Q6UWZ7 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
ABRAXAS1Q6UWZ7 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ABRAXAS1Q6UWZ7 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ABRAXAS1Q6UWZ7 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ABRAXAS1Q6UWZ7 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ABRAXAS1Q6UWZ7 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ABRAXAS1Q6UWZ7 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ABRAXAS1Q6UWZ7 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ABRAXAS1Q6UWZ7 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ABRAXAS1Q6UWZ7 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ABRAXAS1Q6UWZ7 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms