Protein–RNA interactions for Protein: Q6PD62

CTR9, RNA polymerase-associated protein CTR9 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTR9Q6PD62 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CTR9Q6PD62 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CTR9Q6PD62 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CTR9Q6PD62 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CTR9Q6PD62 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CTR9Q6PD62 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CTR9Q6PD62 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CTR9Q6PD62 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CTR9Q6PD62 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CTR9Q6PD62 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.47
CTR9Q6PD62 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
CTR9Q6PD62 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CTR9Q6PD62 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CTR9Q6PD62 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CTR9Q6PD62 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CTR9Q6PD62 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CTR9Q6PD62 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CTR9Q6PD62 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CTR9Q6PD62 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CTR9Q6PD62 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CTR9Q6PD62 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CTR9Q6PD62 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CTR9Q6PD62 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CTR9Q6PD62 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CTR9Q6PD62 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CTR9Q6PD62 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CTR9Q6PD62 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CTR9Q6PD62 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CTR9Q6PD62 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CTR9Q6PD62 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CTR9Q6PD62 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CTR9Q6PD62 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CTR9Q6PD62 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CTR9Q6PD62 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CTR9Q6PD62 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CTR9Q6PD62 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CTR9Q6PD62 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CTR9Q6PD62 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CTR9Q6PD62 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CTR9Q6PD62 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CTR9Q6PD62 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CTR9Q6PD62 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CTR9Q6PD62 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CTR9Q6PD62 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CTR9Q6PD62 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CTR9Q6PD62 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CTR9Q6PD62 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CTR9Q6PD62 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CTR9Q6PD62 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CTR9Q6PD62 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CTR9Q6PD62 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CTR9Q6PD62 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CTR9Q6PD62 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CTR9Q6PD62 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CTR9Q6PD62 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CTR9Q6PD62 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CTR9Q6PD62 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CTR9Q6PD62 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CTR9Q6PD62 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CTR9Q6PD62 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CTR9Q6PD62 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CTR9Q6PD62 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CTR9Q6PD62 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CTR9Q6PD62 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CTR9Q6PD62 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CTR9Q6PD62 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CTR9Q6PD62 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CTR9Q6PD62 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CTR9Q6PD62 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CTR9Q6PD62 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CTR9Q6PD62 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CTR9Q6PD62 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CTR9Q6PD62 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CTR9Q6PD62 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CTR9Q6PD62 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CTR9Q6PD62 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CTR9Q6PD62 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CTR9Q6PD62 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CTR9Q6PD62 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CTR9Q6PD62 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CTR9Q6PD62 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CTR9Q6PD62 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CTR9Q6PD62 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CTR9Q6PD62 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CTR9Q6PD62 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CTR9Q6PD62 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CTR9Q6PD62 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CTR9Q6PD62 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CTR9Q6PD62 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CTR9Q6PD62 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CTR9Q6PD62 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CTR9Q6PD62 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CTR9Q6PD62 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CTR9Q6PD62 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CTR9Q6PD62 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CTR9Q6PD62 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CTR9Q6PD62 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CTR9Q6PD62 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CTR9Q6PD62 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CTR9Q6PD62 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms