Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZY7

CDC42EP5, Cdc42 effector protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42EP5Q6NZY7 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDC42EP5Q6NZY7 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDC42EP5Q6NZY7 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDC42EP5Q6NZY7 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDC42EP5Q6NZY7 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDC42EP5Q6NZY7 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDC42EP5Q6NZY7 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDC42EP5Q6NZY7 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDC42EP5Q6NZY7 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDC42EP5Q6NZY7 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CDC42EP5Q6NZY7 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CDC42EP5Q6NZY7 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CDC42EP5Q6NZY7 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CDC42EP5Q6NZY7 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CDC42EP5Q6NZY7 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CDC42EP5Q6NZY7 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CDC42EP5Q6NZY7 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CDC42EP5Q6NZY7 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CDC42EP5Q6NZY7 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CDC42EP5Q6NZY7 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CDC42EP5Q6NZY7 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CDC42EP5Q6NZY7 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CDC42EP5Q6NZY7 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CDC42EP5Q6NZY7 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CDC42EP5Q6NZY7 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CDC42EP5Q6NZY7 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CDC42EP5Q6NZY7 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CDC42EP5Q6NZY7 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CDC42EP5Q6NZY7 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CDC42EP5Q6NZY7 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CDC42EP5Q6NZY7 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CDC42EP5Q6NZY7 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CDC42EP5Q6NZY7 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CDC42EP5Q6NZY7 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CDC42EP5Q6NZY7 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CDC42EP5Q6NZY7 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CDC42EP5Q6NZY7 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CDC42EP5Q6NZY7 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CDC42EP5Q6NZY7 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CDC42EP5Q6NZY7 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CDC42EP5Q6NZY7 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CDC42EP5Q6NZY7 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CDC42EP5Q6NZY7 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CDC42EP5Q6NZY7 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CDC42EP5Q6NZY7 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CDC42EP5Q6NZY7 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CDC42EP5Q6NZY7 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CDC42EP5Q6NZY7 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CDC42EP5Q6NZY7 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CDC42EP5Q6NZY7 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CDC42EP5Q6NZY7 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CDC42EP5Q6NZY7 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CDC42EP5Q6NZY7 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CDC42EP5Q6NZY7 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CDC42EP5Q6NZY7 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CDC42EP5Q6NZY7 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CDC42EP5Q6NZY7 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CDC42EP5Q6NZY7 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CDC42EP5Q6NZY7 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CDC42EP5Q6NZY7 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CDC42EP5Q6NZY7 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CDC42EP5Q6NZY7 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CDC42EP5Q6NZY7 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CDC42EP5Q6NZY7 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CDC42EP5Q6NZY7 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CDC42EP5Q6NZY7 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CDC42EP5Q6NZY7 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CDC42EP5Q6NZY7 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CDC42EP5Q6NZY7 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CDC42EP5Q6NZY7 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CDC42EP5Q6NZY7 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CDC42EP5Q6NZY7 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CDC42EP5Q6NZY7 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CDC42EP5Q6NZY7 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CDC42EP5Q6NZY7 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CDC42EP5Q6NZY7 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CDC42EP5Q6NZY7 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CDC42EP5Q6NZY7 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CDC42EP5Q6NZY7 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CDC42EP5Q6NZY7 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CDC42EP5Q6NZY7 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CDC42EP5Q6NZY7 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CDC42EP5Q6NZY7 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CDC42EP5Q6NZY7 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CDC42EP5Q6NZY7 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CDC42EP5Q6NZY7 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CDC42EP5Q6NZY7 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CDC42EP5Q6NZY7 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CDC42EP5Q6NZY7 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CDC42EP5Q6NZY7 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CDC42EP5Q6NZY7 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CDC42EP5Q6NZY7 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CDC42EP5Q6NZY7 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CDC42EP5Q6NZY7 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CDC42EP5Q6NZY7 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CDC42EP5Q6NZY7 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CDC42EP5Q6NZY7 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CDC42EP5Q6NZY7 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CDC42EP5Q6NZY7 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CDC42EP5Q6NZY7 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms