Protein–RNA interactions for Protein: Q6IPU0

CENPP, Centromere protein P, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPPQ6IPU0 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CENPPQ6IPU0 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CENPPQ6IPU0 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CENPPQ6IPU0 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CENPPQ6IPU0 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CENPPQ6IPU0 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CENPPQ6IPU0 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CENPPQ6IPU0 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CENPPQ6IPU0 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CENPPQ6IPU0 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CENPPQ6IPU0 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CENPPQ6IPU0 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CENPPQ6IPU0 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CENPPQ6IPU0 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CENPPQ6IPU0 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CENPPQ6IPU0 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CENPPQ6IPU0 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CENPPQ6IPU0 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CENPPQ6IPU0 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CENPPQ6IPU0 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CENPPQ6IPU0 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CENPPQ6IPU0 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CENPPQ6IPU0 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CENPPQ6IPU0 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CENPPQ6IPU0 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CENPPQ6IPU0 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CENPPQ6IPU0 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CENPPQ6IPU0 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CENPPQ6IPU0 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CENPPQ6IPU0 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CENPPQ6IPU0 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CENPPQ6IPU0 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CENPPQ6IPU0 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CENPPQ6IPU0 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CENPPQ6IPU0 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CENPPQ6IPU0 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CENPPQ6IPU0 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CENPPQ6IPU0 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CENPPQ6IPU0 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CENPPQ6IPU0 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CENPPQ6IPU0 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CENPPQ6IPU0 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CENPPQ6IPU0 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CENPPQ6IPU0 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CENPPQ6IPU0 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CENPPQ6IPU0 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CENPPQ6IPU0 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CENPPQ6IPU0 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CENPPQ6IPU0 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CENPPQ6IPU0 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CENPPQ6IPU0 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CENPPQ6IPU0 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CENPPQ6IPU0 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CENPPQ6IPU0 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CENPPQ6IPU0 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CENPPQ6IPU0 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CENPPQ6IPU0 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CENPPQ6IPU0 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CENPPQ6IPU0 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CENPPQ6IPU0 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CENPPQ6IPU0 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CENPPQ6IPU0 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CENPPQ6IPU0 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CENPPQ6IPU0 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CENPPQ6IPU0 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CENPPQ6IPU0 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CENPPQ6IPU0 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CENPPQ6IPU0 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
CENPPQ6IPU0 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CENPPQ6IPU0 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
CENPPQ6IPU0 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.19
CENPPQ6IPU0 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CENPPQ6IPU0 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CENPPQ6IPU0 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CENPPQ6IPU0 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CENPPQ6IPU0 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CENPPQ6IPU0 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CENPPQ6IPU0 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CENPPQ6IPU0 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CENPPQ6IPU0 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CENPPQ6IPU0 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CENPPQ6IPU0 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CENPPQ6IPU0 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CENPPQ6IPU0 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CENPPQ6IPU0 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CENPPQ6IPU0 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CENPPQ6IPU0 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CENPPQ6IPU0 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CENPPQ6IPU0 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CENPPQ6IPU0 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CENPPQ6IPU0 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CENPPQ6IPU0 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CENPPQ6IPU0 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CENPPQ6IPU0 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CENPPQ6IPU0 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CENPPQ6IPU0 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CENPPQ6IPU0 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CENPPQ6IPU0 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CENPPQ6IPU0 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CENPPQ6IPU0 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.7 ms