Protein–RNA interactions for Protein: Q69YQ0

SPECC1L, Cytospin-A, humanhuman

Predictions only

Length 1,117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPECC1LQ69YQ0 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SPECC1LQ69YQ0 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SPECC1LQ69YQ0 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SPECC1LQ69YQ0 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SPECC1LQ69YQ0 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SPECC1LQ69YQ0 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SPECC1LQ69YQ0 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SPECC1LQ69YQ0 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SPECC1LQ69YQ0 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SPECC1LQ69YQ0 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SPECC1LQ69YQ0 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SPECC1LQ69YQ0 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SPECC1LQ69YQ0 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SPECC1LQ69YQ0 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SPECC1LQ69YQ0 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SPECC1LQ69YQ0 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SPECC1LQ69YQ0 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SPECC1LQ69YQ0 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SPECC1LQ69YQ0 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SPECC1LQ69YQ0 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SPECC1LQ69YQ0 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SPECC1LQ69YQ0 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SPECC1LQ69YQ0 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SPECC1LQ69YQ0 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SPECC1LQ69YQ0 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SPECC1LQ69YQ0 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SPECC1LQ69YQ0 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SPECC1LQ69YQ0 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SPECC1LQ69YQ0 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SPECC1LQ69YQ0 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SPECC1LQ69YQ0 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SPECC1LQ69YQ0 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SPECC1LQ69YQ0 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SPECC1LQ69YQ0 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SPECC1LQ69YQ0 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SPECC1LQ69YQ0 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SPECC1LQ69YQ0 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SPECC1LQ69YQ0 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SPECC1LQ69YQ0 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SPECC1LQ69YQ0 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SPECC1LQ69YQ0 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SPECC1LQ69YQ0 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SPECC1LQ69YQ0 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SPECC1LQ69YQ0 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SPECC1LQ69YQ0 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SPECC1LQ69YQ0 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SPECC1LQ69YQ0 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SPECC1LQ69YQ0 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SPECC1LQ69YQ0 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SPECC1LQ69YQ0 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SPECC1LQ69YQ0 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SPECC1LQ69YQ0 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SPECC1LQ69YQ0 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SPECC1LQ69YQ0 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SPECC1LQ69YQ0 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SPECC1LQ69YQ0 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SPECC1LQ69YQ0 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SPECC1LQ69YQ0 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SPECC1LQ69YQ0 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SPECC1LQ69YQ0 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SPECC1LQ69YQ0 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SPECC1LQ69YQ0 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SPECC1LQ69YQ0 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SPECC1LQ69YQ0 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
SPECC1LQ69YQ0 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SPECC1LQ69YQ0 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SPECC1LQ69YQ0 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SPECC1LQ69YQ0 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SPECC1LQ69YQ0 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SPECC1LQ69YQ0 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SPECC1LQ69YQ0 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SPECC1LQ69YQ0 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SPECC1LQ69YQ0 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SPECC1LQ69YQ0 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SPECC1LQ69YQ0 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SPECC1LQ69YQ0 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SPECC1LQ69YQ0 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SPECC1LQ69YQ0 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SPECC1LQ69YQ0 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SPECC1LQ69YQ0 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SPECC1LQ69YQ0 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SPECC1LQ69YQ0 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SPECC1LQ69YQ0 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SPECC1LQ69YQ0 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SPECC1LQ69YQ0 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SPECC1LQ69YQ0 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SPECC1LQ69YQ0 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SPECC1LQ69YQ0 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SPECC1LQ69YQ0 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SPECC1LQ69YQ0 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SPECC1LQ69YQ0 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SPECC1LQ69YQ0 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SPECC1LQ69YQ0 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SPECC1LQ69YQ0 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SPECC1LQ69YQ0 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SPECC1LQ69YQ0 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SPECC1LQ69YQ0 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SPECC1LQ69YQ0 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SPECC1LQ69YQ0 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SPECC1LQ69YQ0 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.5 ms