Protein–RNA interactions for Protein: Q68CJ9

CREB3L3, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 3-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB3L3Q68CJ9 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CREB3L3Q68CJ9 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CREB3L3Q68CJ9 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CREB3L3Q68CJ9 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CREB3L3Q68CJ9 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CREB3L3Q68CJ9 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CREB3L3Q68CJ9 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CREB3L3Q68CJ9 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CREB3L3Q68CJ9 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CREB3L3Q68CJ9 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CREB3L3Q68CJ9 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CREB3L3Q68CJ9 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CREB3L3Q68CJ9 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CREB3L3Q68CJ9 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CREB3L3Q68CJ9 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CREB3L3Q68CJ9 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CREB3L3Q68CJ9 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CREB3L3Q68CJ9 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CREB3L3Q68CJ9 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CREB3L3Q68CJ9 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CREB3L3Q68CJ9 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CREB3L3Q68CJ9 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CREB3L3Q68CJ9 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CREB3L3Q68CJ9 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CREB3L3Q68CJ9 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CREB3L3Q68CJ9 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CREB3L3Q68CJ9 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CREB3L3Q68CJ9 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CREB3L3Q68CJ9 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CREB3L3Q68CJ9 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CREB3L3Q68CJ9 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CREB3L3Q68CJ9 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CREB3L3Q68CJ9 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CREB3L3Q68CJ9 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CREB3L3Q68CJ9 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CREB3L3Q68CJ9 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CREB3L3Q68CJ9 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CREB3L3Q68CJ9 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CREB3L3Q68CJ9 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CREB3L3Q68CJ9 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CREB3L3Q68CJ9 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CREB3L3Q68CJ9 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CREB3L3Q68CJ9 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CREB3L3Q68CJ9 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CREB3L3Q68CJ9 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CREB3L3Q68CJ9 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CREB3L3Q68CJ9 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CREB3L3Q68CJ9 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CREB3L3Q68CJ9 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CREB3L3Q68CJ9 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CREB3L3Q68CJ9 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CREB3L3Q68CJ9 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CREB3L3Q68CJ9 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CREB3L3Q68CJ9 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CREB3L3Q68CJ9 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CREB3L3Q68CJ9 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CREB3L3Q68CJ9 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CREB3L3Q68CJ9 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CREB3L3Q68CJ9 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CREB3L3Q68CJ9 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CREB3L3Q68CJ9 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CREB3L3Q68CJ9 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CREB3L3Q68CJ9 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CREB3L3Q68CJ9 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CREB3L3Q68CJ9 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CREB3L3Q68CJ9 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CREB3L3Q68CJ9 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CREB3L3Q68CJ9 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CREB3L3Q68CJ9 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CREB3L3Q68CJ9 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CREB3L3Q68CJ9 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CREB3L3Q68CJ9 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CREB3L3Q68CJ9 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CREB3L3Q68CJ9 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CREB3L3Q68CJ9 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CREB3L3Q68CJ9 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CREB3L3Q68CJ9 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CREB3L3Q68CJ9 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CREB3L3Q68CJ9 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CREB3L3Q68CJ9 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CREB3L3Q68CJ9 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CREB3L3Q68CJ9 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CREB3L3Q68CJ9 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CREB3L3Q68CJ9 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CREB3L3Q68CJ9 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CREB3L3Q68CJ9 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CREB3L3Q68CJ9 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CREB3L3Q68CJ9 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CREB3L3Q68CJ9 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CREB3L3Q68CJ9 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CREB3L3Q68CJ9 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CREB3L3Q68CJ9 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CREB3L3Q68CJ9 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CREB3L3Q68CJ9 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CREB3L3Q68CJ9 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CREB3L3Q68CJ9 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CREB3L3Q68CJ9 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CREB3L3Q68CJ9 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CREB3L3Q68CJ9 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CREB3L3Q68CJ9 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms