Protein–RNA interactions for Protein: Q676U5

ATG16L1, Autophagy-related protein 16-1, humanhuman

Predictions only

Length 607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG16L1Q676U5 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
ATG16L1Q676U5 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATG16L1Q676U5 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATG16L1Q676U5 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATG16L1Q676U5 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATG16L1Q676U5 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATG16L1Q676U5 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATG16L1Q676U5 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATG16L1Q676U5 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATG16L1Q676U5 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATG16L1Q676U5 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATG16L1Q676U5 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATG16L1Q676U5 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATG16L1Q676U5 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATG16L1Q676U5 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATG16L1Q676U5 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATG16L1Q676U5 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATG16L1Q676U5 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATG16L1Q676U5 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATG16L1Q676U5 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATG16L1Q676U5 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATG16L1Q676U5 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATG16L1Q676U5 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATG16L1Q676U5 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATG16L1Q676U5 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATG16L1Q676U5 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATG16L1Q676U5 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATG16L1Q676U5 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATG16L1Q676U5 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATG16L1Q676U5 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATG16L1Q676U5 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATG16L1Q676U5 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATG16L1Q676U5 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATG16L1Q676U5 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATG16L1Q676U5 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATG16L1Q676U5 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATG16L1Q676U5 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATG16L1Q676U5 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATG16L1Q676U5 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATG16L1Q676U5 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATG16L1Q676U5 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATG16L1Q676U5 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATG16L1Q676U5 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATG16L1Q676U5 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATG16L1Q676U5 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATG16L1Q676U5 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATG16L1Q676U5 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATG16L1Q676U5 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
ATG16L1Q676U5 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATG16L1Q676U5 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATG16L1Q676U5 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATG16L1Q676U5 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATG16L1Q676U5 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
ATG16L1Q676U5 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATG16L1Q676U5 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATG16L1Q676U5 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATG16L1Q676U5 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATG16L1Q676U5 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATG16L1Q676U5 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATG16L1Q676U5 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATG16L1Q676U5 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATG16L1Q676U5 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATG16L1Q676U5 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATG16L1Q676U5 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATG16L1Q676U5 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATG16L1Q676U5 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
ATG16L1Q676U5 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATG16L1Q676U5 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATG16L1Q676U5 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATG16L1Q676U5 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATG16L1Q676U5 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATG16L1Q676U5 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATG16L1Q676U5 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATG16L1Q676U5 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATG16L1Q676U5 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
ATG16L1Q676U5 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATG16L1Q676U5 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATG16L1Q676U5 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATG16L1Q676U5 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATG16L1Q676U5 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATG16L1Q676U5 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATG16L1Q676U5 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATG16L1Q676U5 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATG16L1Q676U5 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATG16L1Q676U5 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATG16L1Q676U5 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATG16L1Q676U5 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATG16L1Q676U5 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATG16L1Q676U5 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATG16L1Q676U5 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATG16L1Q676U5 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATG16L1Q676U5 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATG16L1Q676U5 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATG16L1Q676U5 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATG16L1Q676U5 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATG16L1Q676U5 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATG16L1Q676U5 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATG16L1Q676U5 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATG16L1Q676U5 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATG16L1Q676U5 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms