Protein–RNA interactions for Protein: Q63HN8

RNF213, E3 ubiquitin-protein ligase RNF213, humanhuman

Predictions only

Length 5,207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF213Q63HN8 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
RNF213Q63HN8 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
RNF213Q63HN8 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC11□□□□□ -0.65
RNF213Q63HN8 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
RNF213Q63HN8 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
RNF213Q63HN8 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC11□□□□□ -0.65
RNF213Q63HN8 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
RNF213Q63HN8 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
RNF213Q63HN8 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
RNF213Q63HN8 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
RNF213Q63HN8 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
RNF213Q63HN8 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
RNF213Q63HN8 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC11□□□□□ -0.65
RNF213Q63HN8 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC11□□□□□ -0.65
RNF213Q63HN8 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
RNF213Q63HN8 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
RNF213Q63HN8 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
RNF213Q63HN8 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
RNF213Q63HN8 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
RNF213Q63HN8 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
RNF213Q63HN8 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
RNF213Q63HN8 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
RNF213Q63HN8 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
RNF213Q63HN8 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
RNF213Q63HN8 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
RNF213Q63HN8 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
RNF213Q63HN8 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
RNF213Q63HN8 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
RNF213Q63HN8 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
RNF213Q63HN8 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
RNF213Q63HN8 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
RNF213Q63HN8 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
RNF213Q63HN8 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
RNF213Q63HN8 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
RNF213Q63HN8 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
RNF213Q63HN8 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
RNF213Q63HN8 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
RNF213Q63HN8 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
RNF213Q63HN8 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
RNF213Q63HN8 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC10.99□□□□□ -0.65
RNF213Q63HN8 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
RNF213Q63HN8 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
RNF213Q63HN8 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
RNF213Q63HN8 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
RNF213Q63HN8 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
RNF213Q63HN8 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
RNF213Q63HN8 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
RNF213Q63HN8 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
RNF213Q63HN8 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
RNF213Q63HN8 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
RNF213Q63HN8 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
RNF213Q63HN8 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
RNF213Q63HN8 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
RNF213Q63HN8 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
RNF213Q63HN8 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
RNF213Q63HN8 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
RNF213Q63HN8 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
RNF213Q63HN8 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
RNF213Q63HN8 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
RNF213Q63HN8 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
RNF213Q63HN8 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
RNF213Q63HN8 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
RNF213Q63HN8 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
RNF213Q63HN8 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
RNF213Q63HN8 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
RNF213Q63HN8 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
RNF213Q63HN8 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
RNF213Q63HN8 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
RNF213Q63HN8 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
RNF213Q63HN8 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
RNF213Q63HN8 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
RNF213Q63HN8 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
RNF213Q63HN8 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
RNF213Q63HN8 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
RNF213Q63HN8 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
RNF213Q63HN8 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
RNF213Q63HN8 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
RNF213Q63HN8 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
RNF213Q63HN8 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
RNF213Q63HN8 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
RNF213Q63HN8 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
RNF213Q63HN8 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
RNF213Q63HN8 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
RNF213Q63HN8 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
RNF213Q63HN8 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
RNF213Q63HN8 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
RNF213Q63HN8 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
RNF213Q63HN8 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
RNF213Q63HN8 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
RNF213Q63HN8 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
RNF213Q63HN8 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
RNF213Q63HN8 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
RNF213Q63HN8 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
RNF213Q63HN8 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
RNF213Q63HN8 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
RNF213Q63HN8 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
RNF213Q63HN8 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
RNF213Q63HN8 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
RNF213Q63HN8 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
RNF213Q63HN8 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.7 ms