Protein–RNA interactions for Protein: Q5VYK3

ECM29, Proteasome-associated protein ECM29 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,845 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM29Q5VYK3 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ECM29Q5VYK3 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ECM29Q5VYK3 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ECM29Q5VYK3 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ECM29Q5VYK3 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ECM29Q5VYK3 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ECM29Q5VYK3 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ECM29Q5VYK3 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ECM29Q5VYK3 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ECM29Q5VYK3 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ECM29Q5VYK3 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
ECM29Q5VYK3 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
ECM29Q5VYK3 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ECM29Q5VYK3 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ECM29Q5VYK3 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ECM29Q5VYK3 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ECM29Q5VYK3 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ECM29Q5VYK3 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ECM29Q5VYK3 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ECM29Q5VYK3 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ECM29Q5VYK3 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
ECM29Q5VYK3 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
ECM29Q5VYK3 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ECM29Q5VYK3 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ECM29Q5VYK3 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ECM29Q5VYK3 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ECM29Q5VYK3 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ECM29Q5VYK3 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ECM29Q5VYK3 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ECM29Q5VYK3 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ECM29Q5VYK3 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ECM29Q5VYK3 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ECM29Q5VYK3 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ECM29Q5VYK3 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ECM29Q5VYK3 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ECM29Q5VYK3 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ECM29Q5VYK3 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ECM29Q5VYK3 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ECM29Q5VYK3 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
ECM29Q5VYK3 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ECM29Q5VYK3 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ECM29Q5VYK3 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ECM29Q5VYK3 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
ECM29Q5VYK3 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
ECM29Q5VYK3 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ECM29Q5VYK3 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ECM29Q5VYK3 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
ECM29Q5VYK3 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ECM29Q5VYK3 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ECM29Q5VYK3 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ECM29Q5VYK3 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ECM29Q5VYK3 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ECM29Q5VYK3 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ECM29Q5VYK3 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ECM29Q5VYK3 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ECM29Q5VYK3 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ECM29Q5VYK3 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ECM29Q5VYK3 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ECM29Q5VYK3 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ECM29Q5VYK3 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ECM29Q5VYK3 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ECM29Q5VYK3 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ECM29Q5VYK3 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ECM29Q5VYK3 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ECM29Q5VYK3 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ECM29Q5VYK3 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ECM29Q5VYK3 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ECM29Q5VYK3 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ECM29Q5VYK3 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ECM29Q5VYK3 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ECM29Q5VYK3 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ECM29Q5VYK3 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ECM29Q5VYK3 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ECM29Q5VYK3 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ECM29Q5VYK3 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ECM29Q5VYK3 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ECM29Q5VYK3 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
ECM29Q5VYK3 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ECM29Q5VYK3 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ECM29Q5VYK3 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
ECM29Q5VYK3 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ECM29Q5VYK3 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ECM29Q5VYK3 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ECM29Q5VYK3 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ECM29Q5VYK3 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ECM29Q5VYK3 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ECM29Q5VYK3 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ECM29Q5VYK3 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ECM29Q5VYK3 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ECM29Q5VYK3 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ECM29Q5VYK3 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ECM29Q5VYK3 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ECM29Q5VYK3 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ECM29Q5VYK3 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ECM29Q5VYK3 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ECM29Q5VYK3 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ECM29Q5VYK3 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
ECM29Q5VYK3 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ECM29Q5VYK3 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ECM29Q5VYK3 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms