Protein–RNA interactions for Protein: Q5VX52

SPATA1, Spermatogenesis-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPATA1Q5VX52 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SPATA1Q5VX52 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SPATA1Q5VX52 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SPATA1Q5VX52 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SPATA1Q5VX52 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SPATA1Q5VX52 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SPATA1Q5VX52 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SPATA1Q5VX52 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SPATA1Q5VX52 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SPATA1Q5VX52 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SPATA1Q5VX52 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SPATA1Q5VX52 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SPATA1Q5VX52 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SPATA1Q5VX52 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SPATA1Q5VX52 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SPATA1Q5VX52 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SPATA1Q5VX52 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SPATA1Q5VX52 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SPATA1Q5VX52 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SPATA1Q5VX52 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SPATA1Q5VX52 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SPATA1Q5VX52 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SPATA1Q5VX52 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SPATA1Q5VX52 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SPATA1Q5VX52 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SPATA1Q5VX52 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SPATA1Q5VX52 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SPATA1Q5VX52 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SPATA1Q5VX52 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SPATA1Q5VX52 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SPATA1Q5VX52 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SPATA1Q5VX52 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SPATA1Q5VX52 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SPATA1Q5VX52 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SPATA1Q5VX52 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SPATA1Q5VX52 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SPATA1Q5VX52 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SPATA1Q5VX52 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SPATA1Q5VX52 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SPATA1Q5VX52 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SPATA1Q5VX52 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SPATA1Q5VX52 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SPATA1Q5VX52 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SPATA1Q5VX52 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SPATA1Q5VX52 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SPATA1Q5VX52 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SPATA1Q5VX52 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SPATA1Q5VX52 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SPATA1Q5VX52 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SPATA1Q5VX52 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
SPATA1Q5VX52 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
SPATA1Q5VX52 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
SPATA1Q5VX52 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
SPATA1Q5VX52 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SPATA1Q5VX52 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SPATA1Q5VX52 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SPATA1Q5VX52 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SPATA1Q5VX52 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SPATA1Q5VX52 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SPATA1Q5VX52 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SPATA1Q5VX52 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SPATA1Q5VX52 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SPATA1Q5VX52 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SPATA1Q5VX52 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SPATA1Q5VX52 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SPATA1Q5VX52 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SPATA1Q5VX52 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SPATA1Q5VX52 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SPATA1Q5VX52 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SPATA1Q5VX52 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SPATA1Q5VX52 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SPATA1Q5VX52 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SPATA1Q5VX52 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SPATA1Q5VX52 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SPATA1Q5VX52 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SPATA1Q5VX52 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SPATA1Q5VX52 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SPATA1Q5VX52 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SPATA1Q5VX52 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SPATA1Q5VX52 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SPATA1Q5VX52 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SPATA1Q5VX52 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SPATA1Q5VX52 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SPATA1Q5VX52 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SPATA1Q5VX52 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SPATA1Q5VX52 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SPATA1Q5VX52 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SPATA1Q5VX52 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SPATA1Q5VX52 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SPATA1Q5VX52 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SPATA1Q5VX52 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SPATA1Q5VX52 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SPATA1Q5VX52 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SPATA1Q5VX52 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SPATA1Q5VX52 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SPATA1Q5VX52 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SPATA1Q5VX52 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SPATA1Q5VX52 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SPATA1Q5VX52 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SPATA1Q5VX52 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms