Protein–RNA interactions for Protein: Q5VW36

FOCAD, Focadhesin, humanhuman

Predictions only

Length 1,801 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOCADQ5VW36 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FOCADQ5VW36 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
FOCADQ5VW36 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FOCADQ5VW36 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FOCADQ5VW36 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FOCADQ5VW36 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FOCADQ5VW36 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FOCADQ5VW36 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
FOCADQ5VW36 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
FOCADQ5VW36 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
FOCADQ5VW36 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
FOCADQ5VW36 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FOCADQ5VW36 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
FOCADQ5VW36 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FOCADQ5VW36 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
FOCADQ5VW36 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FOCADQ5VW36 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
FOCADQ5VW36 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
FOCADQ5VW36 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
FOCADQ5VW36 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FOCADQ5VW36 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
FOCADQ5VW36 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FOCADQ5VW36 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FOCADQ5VW36 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
FOCADQ5VW36 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FOCADQ5VW36 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FOCADQ5VW36 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FOCADQ5VW36 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FOCADQ5VW36 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FOCADQ5VW36 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FOCADQ5VW36 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
FOCADQ5VW36 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
FOCADQ5VW36 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
FOCADQ5VW36 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
FOCADQ5VW36 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
FOCADQ5VW36 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FOCADQ5VW36 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
FOCADQ5VW36 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
FOCADQ5VW36 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
FOCADQ5VW36 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
FOCADQ5VW36 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
FOCADQ5VW36 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
FOCADQ5VW36 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
FOCADQ5VW36 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
FOCADQ5VW36 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
FOCADQ5VW36 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
FOCADQ5VW36 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
FOCADQ5VW36 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
FOCADQ5VW36 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
FOCADQ5VW36 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
FOCADQ5VW36 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
FOCADQ5VW36 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
FOCADQ5VW36 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
FOCADQ5VW36 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
FOCADQ5VW36 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
FOCADQ5VW36 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
FOCADQ5VW36 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
FOCADQ5VW36 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
FOCADQ5VW36 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
FOCADQ5VW36 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
FOCADQ5VW36 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
FOCADQ5VW36 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
FOCADQ5VW36 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
FOCADQ5VW36 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
FOCADQ5VW36 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
FOCADQ5VW36 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.44
FOCADQ5VW36 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
FOCADQ5VW36 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FOCADQ5VW36 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
FOCADQ5VW36 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FOCADQ5VW36 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
FOCADQ5VW36 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FOCADQ5VW36 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
FOCADQ5VW36 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
FOCADQ5VW36 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
FOCADQ5VW36 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
FOCADQ5VW36 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
FOCADQ5VW36 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FOCADQ5VW36 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
FOCADQ5VW36 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
FOCADQ5VW36 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
FOCADQ5VW36 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
FOCADQ5VW36 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
FOCADQ5VW36 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
FOCADQ5VW36 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
FOCADQ5VW36 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
FOCADQ5VW36 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
FOCADQ5VW36 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
FOCADQ5VW36 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
FOCADQ5VW36 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
FOCADQ5VW36 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
FOCADQ5VW36 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
FOCADQ5VW36 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
FOCADQ5VW36 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
FOCADQ5VW36 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
FOCADQ5VW36 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
FOCADQ5VW36 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
FOCADQ5VW36 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
FOCADQ5VW36 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
FOCADQ5VW36 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms