Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTD9

GFI1B, Zinc finger protein Gfi-1b, humanhuman

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Length 330 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFI1BQ5VTD9 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GFI1BQ5VTD9 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GFI1BQ5VTD9 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GFI1BQ5VTD9 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GFI1BQ5VTD9 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GFI1BQ5VTD9 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GFI1BQ5VTD9 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GFI1BQ5VTD9 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GFI1BQ5VTD9 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GFI1BQ5VTD9 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GFI1BQ5VTD9 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GFI1BQ5VTD9 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GFI1BQ5VTD9 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GFI1BQ5VTD9 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GFI1BQ5VTD9 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GFI1BQ5VTD9 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GFI1BQ5VTD9 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GFI1BQ5VTD9 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GFI1BQ5VTD9 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GFI1BQ5VTD9 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GFI1BQ5VTD9 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GFI1BQ5VTD9 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GFI1BQ5VTD9 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GFI1BQ5VTD9 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GFI1BQ5VTD9 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GFI1BQ5VTD9 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GFI1BQ5VTD9 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GFI1BQ5VTD9 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GFI1BQ5VTD9 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GFI1BQ5VTD9 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GFI1BQ5VTD9 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GFI1BQ5VTD9 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GFI1BQ5VTD9 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GFI1BQ5VTD9 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GFI1BQ5VTD9 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GFI1BQ5VTD9 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GFI1BQ5VTD9 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GFI1BQ5VTD9 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GFI1BQ5VTD9 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GFI1BQ5VTD9 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GFI1BQ5VTD9 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GFI1BQ5VTD9 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GFI1BQ5VTD9 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GFI1BQ5VTD9 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GFI1BQ5VTD9 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GFI1BQ5VTD9 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
GFI1BQ5VTD9 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GFI1BQ5VTD9 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GFI1BQ5VTD9 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GFI1BQ5VTD9 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GFI1BQ5VTD9 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GFI1BQ5VTD9 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GFI1BQ5VTD9 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GFI1BQ5VTD9 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GFI1BQ5VTD9 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GFI1BQ5VTD9 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GFI1BQ5VTD9 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GFI1BQ5VTD9 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GFI1BQ5VTD9 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GFI1BQ5VTD9 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GFI1BQ5VTD9 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GFI1BQ5VTD9 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GFI1BQ5VTD9 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GFI1BQ5VTD9 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GFI1BQ5VTD9 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GFI1BQ5VTD9 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GFI1BQ5VTD9 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GFI1BQ5VTD9 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
GFI1BQ5VTD9 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
GFI1BQ5VTD9 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GFI1BQ5VTD9 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
GFI1BQ5VTD9 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GFI1BQ5VTD9 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GFI1BQ5VTD9 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GFI1BQ5VTD9 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GFI1BQ5VTD9 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GFI1BQ5VTD9 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GFI1BQ5VTD9 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GFI1BQ5VTD9 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GFI1BQ5VTD9 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GFI1BQ5VTD9 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GFI1BQ5VTD9 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GFI1BQ5VTD9 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GFI1BQ5VTD9 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GFI1BQ5VTD9 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GFI1BQ5VTD9 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GFI1BQ5VTD9 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GFI1BQ5VTD9 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GFI1BQ5VTD9 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GFI1BQ5VTD9 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
GFI1BQ5VTD9 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GFI1BQ5VTD9 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GFI1BQ5VTD9 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GFI1BQ5VTD9 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GFI1BQ5VTD9 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GFI1BQ5VTD9 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GFI1BQ5VTD9 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GFI1BQ5VTD9 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GFI1BQ5VTD9 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GFI1BQ5VTD9 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
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