Protein–RNA interactions for Protein: Q5T215

TRAPPC3L, Trafficking protein particle complex subunit 3-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC3LQ5T215 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TRAPPC3LQ5T215 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TRAPPC3LQ5T215 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TRAPPC3LQ5T215 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TRAPPC3LQ5T215 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TRAPPC3LQ5T215 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TRAPPC3LQ5T215 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TRAPPC3LQ5T215 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TRAPPC3LQ5T215 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TRAPPC3LQ5T215 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TRAPPC3LQ5T215 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TRAPPC3LQ5T215 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
TRAPPC3LQ5T215 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TRAPPC3LQ5T215 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TRAPPC3LQ5T215 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TRAPPC3LQ5T215 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TRAPPC3LQ5T215 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TRAPPC3LQ5T215 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TRAPPC3LQ5T215 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TRAPPC3LQ5T215 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TRAPPC3LQ5T215 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TRAPPC3LQ5T215 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TRAPPC3LQ5T215 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TRAPPC3LQ5T215 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TRAPPC3LQ5T215 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TRAPPC3LQ5T215 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TRAPPC3LQ5T215 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TRAPPC3LQ5T215 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TRAPPC3LQ5T215 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TRAPPC3LQ5T215 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TRAPPC3LQ5T215 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TRAPPC3LQ5T215 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TRAPPC3LQ5T215 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TRAPPC3LQ5T215 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TRAPPC3LQ5T215 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
TRAPPC3LQ5T215 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TRAPPC3LQ5T215 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TRAPPC3LQ5T215 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TRAPPC3LQ5T215 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TRAPPC3LQ5T215 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TRAPPC3LQ5T215 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TRAPPC3LQ5T215 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TRAPPC3LQ5T215 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TRAPPC3LQ5T215 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TRAPPC3LQ5T215 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TRAPPC3LQ5T215 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TRAPPC3LQ5T215 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TRAPPC3LQ5T215 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TRAPPC3LQ5T215 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TRAPPC3LQ5T215 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
TRAPPC3LQ5T215 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TRAPPC3LQ5T215 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TRAPPC3LQ5T215 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TRAPPC3LQ5T215 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TRAPPC3LQ5T215 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TRAPPC3LQ5T215 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TRAPPC3LQ5T215 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TRAPPC3LQ5T215 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TRAPPC3LQ5T215 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TRAPPC3LQ5T215 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TRAPPC3LQ5T215 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
TRAPPC3LQ5T215 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TRAPPC3LQ5T215 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TRAPPC3LQ5T215 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TRAPPC3LQ5T215 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TRAPPC3LQ5T215 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TRAPPC3LQ5T215 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
TRAPPC3LQ5T215 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
TRAPPC3LQ5T215 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TRAPPC3LQ5T215 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TRAPPC3LQ5T215 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TRAPPC3LQ5T215 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TRAPPC3LQ5T215 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TRAPPC3LQ5T215 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TRAPPC3LQ5T215 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TRAPPC3LQ5T215 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TRAPPC3LQ5T215 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TRAPPC3LQ5T215 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TRAPPC3LQ5T215 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TRAPPC3LQ5T215 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TRAPPC3LQ5T215 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TRAPPC3LQ5T215 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TRAPPC3LQ5T215 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TRAPPC3LQ5T215 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TRAPPC3LQ5T215 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TRAPPC3LQ5T215 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TRAPPC3LQ5T215 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TRAPPC3LQ5T215 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRAPPC3LQ5T215 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRAPPC3LQ5T215 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRAPPC3LQ5T215 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRAPPC3LQ5T215 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRAPPC3LQ5T215 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
TRAPPC3LQ5T215 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRAPPC3LQ5T215 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRAPPC3LQ5T215 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRAPPC3LQ5T215 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
TRAPPC3LQ5T215 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRAPPC3LQ5T215 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRAPPC3LQ5T215 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms