Protein–RNA interactions for Protein: Q5SW96

LDLRAP1, Low density lipoprotein receptor adapter protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LDLRAP1Q5SW96 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LDLRAP1Q5SW96 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
LDLRAP1Q5SW96 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
LDLRAP1Q5SW96 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LDLRAP1Q5SW96 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
LDLRAP1Q5SW96 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LDLRAP1Q5SW96 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LDLRAP1Q5SW96 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
LDLRAP1Q5SW96 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LDLRAP1Q5SW96 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
LDLRAP1Q5SW96 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
LDLRAP1Q5SW96 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
LDLRAP1Q5SW96 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC20.25■□□□□ 0.83
LDLRAP1Q5SW96 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
LDLRAP1Q5SW96 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
LDLRAP1Q5SW96 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
LDLRAP1Q5SW96 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
LDLRAP1Q5SW96 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LDLRAP1Q5SW96 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LDLRAP1Q5SW96 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
LDLRAP1Q5SW96 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LDLRAP1Q5SW96 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
LDLRAP1Q5SW96 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LDLRAP1Q5SW96 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
LDLRAP1Q5SW96 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LDLRAP1Q5SW96 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
LDLRAP1Q5SW96 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LDLRAP1Q5SW96 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
LDLRAP1Q5SW96 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LDLRAP1Q5SW96 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LDLRAP1Q5SW96 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
LDLRAP1Q5SW96 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LDLRAP1Q5SW96 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LDLRAP1Q5SW96 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
LDLRAP1Q5SW96 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LDLRAP1Q5SW96 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
LDLRAP1Q5SW96 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
LDLRAP1Q5SW96 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
LDLRAP1Q5SW96 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
LDLRAP1Q5SW96 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LDLRAP1Q5SW96 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
LDLRAP1Q5SW96 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LDLRAP1Q5SW96 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
LDLRAP1Q5SW96 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LDLRAP1Q5SW96 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
LDLRAP1Q5SW96 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LDLRAP1Q5SW96 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LDLRAP1Q5SW96 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
LDLRAP1Q5SW96 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LDLRAP1Q5SW96 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
LDLRAP1Q5SW96 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LDLRAP1Q5SW96 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LDLRAP1Q5SW96 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LDLRAP1Q5SW96 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LDLRAP1Q5SW96 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LDLRAP1Q5SW96 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
LDLRAP1Q5SW96 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
LDLRAP1Q5SW96 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LDLRAP1Q5SW96 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
LDLRAP1Q5SW96 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
LDLRAP1Q5SW96 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
LDLRAP1Q5SW96 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LDLRAP1Q5SW96 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
LDLRAP1Q5SW96 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
LDLRAP1Q5SW96 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
LDLRAP1Q5SW96 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LDLRAP1Q5SW96 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LDLRAP1Q5SW96 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
LDLRAP1Q5SW96 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LDLRAP1Q5SW96 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LDLRAP1Q5SW96 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LDLRAP1Q5SW96 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
LDLRAP1Q5SW96 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
LDLRAP1Q5SW96 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
LDLRAP1Q5SW96 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
LDLRAP1Q5SW96 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
LDLRAP1Q5SW96 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
LDLRAP1Q5SW96 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
LDLRAP1Q5SW96 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LDLRAP1Q5SW96 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LDLRAP1Q5SW96 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LDLRAP1Q5SW96 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
LDLRAP1Q5SW96 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
LDLRAP1Q5SW96 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LDLRAP1Q5SW96 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LDLRAP1Q5SW96 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LDLRAP1Q5SW96 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
LDLRAP1Q5SW96 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
LDLRAP1Q5SW96 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
LDLRAP1Q5SW96 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LDLRAP1Q5SW96 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LDLRAP1Q5SW96 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
LDLRAP1Q5SW96 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
LDLRAP1Q5SW96 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
LDLRAP1Q5SW96 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
LDLRAP1Q5SW96 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LDLRAP1Q5SW96 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
LDLRAP1Q5SW96 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
LDLRAP1Q5SW96 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
LDLRAP1Q5SW96 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms