Protein–RNA interactions for Protein: Q5GLZ8

HERC4, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,057 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC4Q5GLZ8 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HERC4Q5GLZ8 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HERC4Q5GLZ8 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HERC4Q5GLZ8 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HERC4Q5GLZ8 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HERC4Q5GLZ8 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HERC4Q5GLZ8 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HERC4Q5GLZ8 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HERC4Q5GLZ8 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HERC4Q5GLZ8 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HERC4Q5GLZ8 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HERC4Q5GLZ8 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HERC4Q5GLZ8 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HERC4Q5GLZ8 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HERC4Q5GLZ8 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HERC4Q5GLZ8 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HERC4Q5GLZ8 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HERC4Q5GLZ8 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HERC4Q5GLZ8 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HERC4Q5GLZ8 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HERC4Q5GLZ8 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HERC4Q5GLZ8 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HERC4Q5GLZ8 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HERC4Q5GLZ8 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HERC4Q5GLZ8 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HERC4Q5GLZ8 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HERC4Q5GLZ8 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HERC4Q5GLZ8 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HERC4Q5GLZ8 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HERC4Q5GLZ8 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
HERC4Q5GLZ8 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HERC4Q5GLZ8 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
HERC4Q5GLZ8 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
HERC4Q5GLZ8 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HERC4Q5GLZ8 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
HERC4Q5GLZ8 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HERC4Q5GLZ8 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HERC4Q5GLZ8 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HERC4Q5GLZ8 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HERC4Q5GLZ8 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
HERC4Q5GLZ8 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
HERC4Q5GLZ8 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.7■■□□□ 1.23
HERC4Q5GLZ8 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HERC4Q5GLZ8 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HERC4Q5GLZ8 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HERC4Q5GLZ8 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HERC4Q5GLZ8 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HERC4Q5GLZ8 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
HERC4Q5GLZ8 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HERC4Q5GLZ8 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HERC4Q5GLZ8 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HERC4Q5GLZ8 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HERC4Q5GLZ8 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
HERC4Q5GLZ8 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HERC4Q5GLZ8 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HERC4Q5GLZ8 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HERC4Q5GLZ8 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HERC4Q5GLZ8 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HERC4Q5GLZ8 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HERC4Q5GLZ8 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HERC4Q5GLZ8 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HERC4Q5GLZ8 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HERC4Q5GLZ8 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HERC4Q5GLZ8 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HERC4Q5GLZ8 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HERC4Q5GLZ8 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HERC4Q5GLZ8 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HERC4Q5GLZ8 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HERC4Q5GLZ8 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HERC4Q5GLZ8 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HERC4Q5GLZ8 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HERC4Q5GLZ8 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HERC4Q5GLZ8 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HERC4Q5GLZ8 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HERC4Q5GLZ8 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HERC4Q5GLZ8 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HERC4Q5GLZ8 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HERC4Q5GLZ8 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HERC4Q5GLZ8 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HERC4Q5GLZ8 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HERC4Q5GLZ8 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HERC4Q5GLZ8 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HERC4Q5GLZ8 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HERC4Q5GLZ8 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HERC4Q5GLZ8 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HERC4Q5GLZ8 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HERC4Q5GLZ8 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HERC4Q5GLZ8 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
HERC4Q5GLZ8 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HERC4Q5GLZ8 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HERC4Q5GLZ8 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HERC4Q5GLZ8 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
HERC4Q5GLZ8 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HERC4Q5GLZ8 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
HERC4Q5GLZ8 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HERC4Q5GLZ8 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
HERC4Q5GLZ8 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HERC4Q5GLZ8 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HERC4Q5GLZ8 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HERC4Q5GLZ8 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms