Protein–RNA interactions for Protein: Q5C9Z4

NOM1, Nucleolar MIF4G domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 860 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOM1Q5C9Z4 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NOM1Q5C9Z4 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NOM1Q5C9Z4 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NOM1Q5C9Z4 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NOM1Q5C9Z4 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NOM1Q5C9Z4 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NOM1Q5C9Z4 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NOM1Q5C9Z4 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NOM1Q5C9Z4 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NOM1Q5C9Z4 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NOM1Q5C9Z4 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NOM1Q5C9Z4 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NOM1Q5C9Z4 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NOM1Q5C9Z4 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NOM1Q5C9Z4 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NOM1Q5C9Z4 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NOM1Q5C9Z4 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NOM1Q5C9Z4 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NOM1Q5C9Z4 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NOM1Q5C9Z4 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NOM1Q5C9Z4 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NOM1Q5C9Z4 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NOM1Q5C9Z4 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NOM1Q5C9Z4 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NOM1Q5C9Z4 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NOM1Q5C9Z4 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NOM1Q5C9Z4 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NOM1Q5C9Z4 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NOM1Q5C9Z4 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
NOM1Q5C9Z4 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NOM1Q5C9Z4 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
NOM1Q5C9Z4 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
NOM1Q5C9Z4 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
NOM1Q5C9Z4 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NOM1Q5C9Z4 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NOM1Q5C9Z4 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NOM1Q5C9Z4 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NOM1Q5C9Z4 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NOM1Q5C9Z4 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NOM1Q5C9Z4 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NOM1Q5C9Z4 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
NOM1Q5C9Z4 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NOM1Q5C9Z4 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NOM1Q5C9Z4 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NOM1Q5C9Z4 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
NOM1Q5C9Z4 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NOM1Q5C9Z4 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NOM1Q5C9Z4 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NOM1Q5C9Z4 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NOM1Q5C9Z4 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NOM1Q5C9Z4 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NOM1Q5C9Z4 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NOM1Q5C9Z4 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NOM1Q5C9Z4 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NOM1Q5C9Z4 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NOM1Q5C9Z4 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NOM1Q5C9Z4 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NOM1Q5C9Z4 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NOM1Q5C9Z4 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NOM1Q5C9Z4 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
NOM1Q5C9Z4 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NOM1Q5C9Z4 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NOM1Q5C9Z4 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NOM1Q5C9Z4 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NOM1Q5C9Z4 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NOM1Q5C9Z4 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NOM1Q5C9Z4 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NOM1Q5C9Z4 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NOM1Q5C9Z4 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
NOM1Q5C9Z4 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NOM1Q5C9Z4 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NOM1Q5C9Z4 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NOM1Q5C9Z4 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NOM1Q5C9Z4 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NOM1Q5C9Z4 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NOM1Q5C9Z4 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NOM1Q5C9Z4 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NOM1Q5C9Z4 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NOM1Q5C9Z4 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NOM1Q5C9Z4 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NOM1Q5C9Z4 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NOM1Q5C9Z4 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NOM1Q5C9Z4 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NOM1Q5C9Z4 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NOM1Q5C9Z4 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NOM1Q5C9Z4 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NOM1Q5C9Z4 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NOM1Q5C9Z4 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NOM1Q5C9Z4 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NOM1Q5C9Z4 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NOM1Q5C9Z4 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NOM1Q5C9Z4 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NOM1Q5C9Z4 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NOM1Q5C9Z4 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NOM1Q5C9Z4 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
NOM1Q5C9Z4 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NOM1Q5C9Z4 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NOM1Q5C9Z4 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NOM1Q5C9Z4 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NOM1Q5C9Z4 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms