Protein–RNA interactions for Protein: Q587I9

SFT2D3, Vesicle transport protein SFT2C, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFT2D3Q587I9 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SFT2D3Q587I9 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SFT2D3Q587I9 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SFT2D3Q587I9 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SFT2D3Q587I9 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SFT2D3Q587I9 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SFT2D3Q587I9 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SFT2D3Q587I9 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SFT2D3Q587I9 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
SFT2D3Q587I9 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SFT2D3Q587I9 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SFT2D3Q587I9 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SFT2D3Q587I9 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SFT2D3Q587I9 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SFT2D3Q587I9 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SFT2D3Q587I9 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SFT2D3Q587I9 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SFT2D3Q587I9 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SFT2D3Q587I9 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SFT2D3Q587I9 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SFT2D3Q587I9 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SFT2D3Q587I9 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SFT2D3Q587I9 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SFT2D3Q587I9 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SFT2D3Q587I9 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SFT2D3Q587I9 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SFT2D3Q587I9 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SFT2D3Q587I9 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SFT2D3Q587I9 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
SFT2D3Q587I9 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SFT2D3Q587I9 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SFT2D3Q587I9 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
SFT2D3Q587I9 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SFT2D3Q587I9 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SFT2D3Q587I9 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
SFT2D3Q587I9 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SFT2D3Q587I9 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
SFT2D3Q587I9 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SFT2D3Q587I9 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SFT2D3Q587I9 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SFT2D3Q587I9 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SFT2D3Q587I9 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SFT2D3Q587I9 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SFT2D3Q587I9 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SFT2D3Q587I9 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SFT2D3Q587I9 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SFT2D3Q587I9 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SFT2D3Q587I9 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SFT2D3Q587I9 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SFT2D3Q587I9 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SFT2D3Q587I9 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SFT2D3Q587I9 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SFT2D3Q587I9 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SFT2D3Q587I9 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SFT2D3Q587I9 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SFT2D3Q587I9 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SFT2D3Q587I9 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SFT2D3Q587I9 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SFT2D3Q587I9 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SFT2D3Q587I9 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SFT2D3Q587I9 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SFT2D3Q587I9 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SFT2D3Q587I9 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
SFT2D3Q587I9 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SFT2D3Q587I9 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SFT2D3Q587I9 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SFT2D3Q587I9 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SFT2D3Q587I9 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
SFT2D3Q587I9 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
SFT2D3Q587I9 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
SFT2D3Q587I9 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
SFT2D3Q587I9 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SFT2D3Q587I9 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SFT2D3Q587I9 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SFT2D3Q587I9 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SFT2D3Q587I9 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SFT2D3Q587I9 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SFT2D3Q587I9 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SFT2D3Q587I9 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SFT2D3Q587I9 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SFT2D3Q587I9 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SFT2D3Q587I9 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SFT2D3Q587I9 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SFT2D3Q587I9 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SFT2D3Q587I9 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SFT2D3Q587I9 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SFT2D3Q587I9 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SFT2D3Q587I9 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SFT2D3Q587I9 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SFT2D3Q587I9 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SFT2D3Q587I9 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SFT2D3Q587I9 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SFT2D3Q587I9 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SFT2D3Q587I9 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SFT2D3Q587I9 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SFT2D3Q587I9 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SFT2D3Q587I9 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
SFT2D3Q587I9 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SFT2D3Q587I9 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SFT2D3Q587I9 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms