Protein–RNA interactions for Protein: Q56UQ5

TPT1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q56UQ5 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q56UQ5 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q56UQ5 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q56UQ5 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q56UQ5 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q56UQ5 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q56UQ5 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q56UQ5 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q56UQ5 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q56UQ5 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q56UQ5 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q56UQ5 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q56UQ5 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q56UQ5 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q56UQ5 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q56UQ5 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q56UQ5 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q56UQ5 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q56UQ5 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q56UQ5 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q56UQ5 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q56UQ5 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q56UQ5 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q56UQ5 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q56UQ5 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q56UQ5 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q56UQ5 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q56UQ5 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q56UQ5 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q56UQ5 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q56UQ5 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q56UQ5 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q56UQ5 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q56UQ5 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q56UQ5 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q56UQ5 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q56UQ5 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q56UQ5 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q56UQ5 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q56UQ5 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q56UQ5 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Q56UQ5 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q56UQ5 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q56UQ5 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q56UQ5 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q56UQ5 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q56UQ5 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q56UQ5 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q56UQ5 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q56UQ5 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q56UQ5 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q56UQ5 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q56UQ5 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q56UQ5 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q56UQ5 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q56UQ5 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q56UQ5 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q56UQ5 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q56UQ5 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q56UQ5 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q56UQ5 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q56UQ5 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q56UQ5 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q56UQ5 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q56UQ5 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q56UQ5 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Q56UQ5 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q56UQ5 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q56UQ5 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q56UQ5 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q56UQ5 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q56UQ5 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q56UQ5 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Q56UQ5 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Q56UQ5 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q56UQ5 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q56UQ5 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q56UQ5 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q56UQ5 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q56UQ5 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Q56UQ5 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q56UQ5 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q56UQ5 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Q56UQ5 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q56UQ5 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q56UQ5 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q56UQ5 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q56UQ5 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q56UQ5 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Q56UQ5 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Q56UQ5 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Q56UQ5 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Q56UQ5 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Q56UQ5 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Q56UQ5 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Q56UQ5 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Q56UQ5 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Q56UQ5 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q56UQ5 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q56UQ5 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms