Protein–RNA interactions for Protein: Q502W7

CCDC38, Coiled-coil domain-containing protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC38Q502W7 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC38Q502W7 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC38Q502W7 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC38Q502W7 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC38Q502W7 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC38Q502W7 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC38Q502W7 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC38Q502W7 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC38Q502W7 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC38Q502W7 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC38Q502W7 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC38Q502W7 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC38Q502W7 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC38Q502W7 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC38Q502W7 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC38Q502W7 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC38Q502W7 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC38Q502W7 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC38Q502W7 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC38Q502W7 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC38Q502W7 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC38Q502W7 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC38Q502W7 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC38Q502W7 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC38Q502W7 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC38Q502W7 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC38Q502W7 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC38Q502W7 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC38Q502W7 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC38Q502W7 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
CCDC38Q502W7 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
CCDC38Q502W7 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
CCDC38Q502W7 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC38Q502W7 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC38Q502W7 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC38Q502W7 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC38Q502W7 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC38Q502W7 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC38Q502W7 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC38Q502W7 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC38Q502W7 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC38Q502W7 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC38Q502W7 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC38Q502W7 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC38Q502W7 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC38Q502W7 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC38Q502W7 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC38Q502W7 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC38Q502W7 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC38Q502W7 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC38Q502W7 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC38Q502W7 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC38Q502W7 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC38Q502W7 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC38Q502W7 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC38Q502W7 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC38Q502W7 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC38Q502W7 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC38Q502W7 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC38Q502W7 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC38Q502W7 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC38Q502W7 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC38Q502W7 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC38Q502W7 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC38Q502W7 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC38Q502W7 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC38Q502W7 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC38Q502W7 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC38Q502W7 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC38Q502W7 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC38Q502W7 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC38Q502W7 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC38Q502W7 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC38Q502W7 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC38Q502W7 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC38Q502W7 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC38Q502W7 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC38Q502W7 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC38Q502W7 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC38Q502W7 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC38Q502W7 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC38Q502W7 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC38Q502W7 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC38Q502W7 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC38Q502W7 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC38Q502W7 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC38Q502W7 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC38Q502W7 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC38Q502W7 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC38Q502W7 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC38Q502W7 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC38Q502W7 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC38Q502W7 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC38Q502W7 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC38Q502W7 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC38Q502W7 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC38Q502W7 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC38Q502W7 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCDC38Q502W7 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCDC38Q502W7 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.4 ms