Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZG55

GREB1, Protein GREB1, humanhuman

Predictions only

Length 1,949 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GREB1Q4ZG55 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
GREB1Q4ZG55 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
GREB1Q4ZG55 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GREB1Q4ZG55 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GREB1Q4ZG55 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GREB1Q4ZG55 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GREB1Q4ZG55 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
GREB1Q4ZG55 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
GREB1Q4ZG55 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
GREB1Q4ZG55 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
GREB1Q4ZG55 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GREB1Q4ZG55 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
GREB1Q4ZG55 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
GREB1Q4ZG55 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GREB1Q4ZG55 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
GREB1Q4ZG55 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC21.27■■□□□ 1
GREB1Q4ZG55 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GREB1Q4ZG55 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
GREB1Q4ZG55 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GREB1Q4ZG55 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GREB1Q4ZG55 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GREB1Q4ZG55 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
GREB1Q4ZG55 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
GREB1Q4ZG55 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GREB1Q4ZG55 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GREB1Q4ZG55 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GREB1Q4ZG55 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GREB1Q4ZG55 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GREB1Q4ZG55 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GREB1Q4ZG55 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GREB1Q4ZG55 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GREB1Q4ZG55 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GREB1Q4ZG55 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GREB1Q4ZG55 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
GREB1Q4ZG55 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GREB1Q4ZG55 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GREB1Q4ZG55 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GREB1Q4ZG55 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GREB1Q4ZG55 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GREB1Q4ZG55 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GREB1Q4ZG55 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GREB1Q4ZG55 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GREB1Q4ZG55 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GREB1Q4ZG55 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GREB1Q4ZG55 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GREB1Q4ZG55 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GREB1Q4ZG55 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GREB1Q4ZG55 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GREB1Q4ZG55 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GREB1Q4ZG55 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
GREB1Q4ZG55 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
GREB1Q4ZG55 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GREB1Q4ZG55 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GREB1Q4ZG55 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GREB1Q4ZG55 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GREB1Q4ZG55 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GREB1Q4ZG55 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GREB1Q4ZG55 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GREB1Q4ZG55 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GREB1Q4ZG55 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GREB1Q4ZG55 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GREB1Q4ZG55 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
GREB1Q4ZG55 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GREB1Q4ZG55 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GREB1Q4ZG55 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GREB1Q4ZG55 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GREB1Q4ZG55 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GREB1Q4ZG55 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GREB1Q4ZG55 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GREB1Q4ZG55 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GREB1Q4ZG55 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GREB1Q4ZG55 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GREB1Q4ZG55 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GREB1Q4ZG55 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GREB1Q4ZG55 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GREB1Q4ZG55 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
GREB1Q4ZG55 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GREB1Q4ZG55 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GREB1Q4ZG55 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GREB1Q4ZG55 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GREB1Q4ZG55 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GREB1Q4ZG55 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GREB1Q4ZG55 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
GREB1Q4ZG55 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GREB1Q4ZG55 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GREB1Q4ZG55 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GREB1Q4ZG55 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GREB1Q4ZG55 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GREB1Q4ZG55 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GREB1Q4ZG55 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GREB1Q4ZG55 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GREB1Q4ZG55 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GREB1Q4ZG55 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GREB1Q4ZG55 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GREB1Q4ZG55 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GREB1Q4ZG55 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GREB1Q4ZG55 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GREB1Q4ZG55 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GREB1Q4ZG55 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GREB1Q4ZG55 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms