Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDR2

CTXN3, Cortexin-3, humanhuman

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Length 81 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN3Q4LDR2 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CTXN3Q4LDR2 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CTXN3Q4LDR2 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CTXN3Q4LDR2 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CTXN3Q4LDR2 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CTXN3Q4LDR2 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CTXN3Q4LDR2 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CTXN3Q4LDR2 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CTXN3Q4LDR2 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CTXN3Q4LDR2 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CTXN3Q4LDR2 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CTXN3Q4LDR2 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CTXN3Q4LDR2 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CTXN3Q4LDR2 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CTXN3Q4LDR2 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CTXN3Q4LDR2 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CTXN3Q4LDR2 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CTXN3Q4LDR2 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CTXN3Q4LDR2 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CTXN3Q4LDR2 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CTXN3Q4LDR2 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CTXN3Q4LDR2 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CTXN3Q4LDR2 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CTXN3Q4LDR2 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CTXN3Q4LDR2 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CTXN3Q4LDR2 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CTXN3Q4LDR2 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CTXN3Q4LDR2 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CTXN3Q4LDR2 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CTXN3Q4LDR2 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CTXN3Q4LDR2 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CTXN3Q4LDR2 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CTXN3Q4LDR2 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CTXN3Q4LDR2 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CTXN3Q4LDR2 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CTXN3Q4LDR2 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CTXN3Q4LDR2 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CTXN3Q4LDR2 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CTXN3Q4LDR2 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CTXN3Q4LDR2 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CTXN3Q4LDR2 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CTXN3Q4LDR2 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CTXN3Q4LDR2 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CTXN3Q4LDR2 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CTXN3Q4LDR2 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CTXN3Q4LDR2 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
CTXN3Q4LDR2 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CTXN3Q4LDR2 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CTXN3Q4LDR2 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
CTXN3Q4LDR2 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
CTXN3Q4LDR2 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CTXN3Q4LDR2 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CTXN3Q4LDR2 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CTXN3Q4LDR2 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CTXN3Q4LDR2 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CTXN3Q4LDR2 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CTXN3Q4LDR2 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CTXN3Q4LDR2 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CTXN3Q4LDR2 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CTXN3Q4LDR2 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CTXN3Q4LDR2 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CTXN3Q4LDR2 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CTXN3Q4LDR2 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CTXN3Q4LDR2 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CTXN3Q4LDR2 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CTXN3Q4LDR2 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CTXN3Q4LDR2 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CTXN3Q4LDR2 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CTXN3Q4LDR2 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CTXN3Q4LDR2 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CTXN3Q4LDR2 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CTXN3Q4LDR2 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CTXN3Q4LDR2 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CTXN3Q4LDR2 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CTXN3Q4LDR2 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CTXN3Q4LDR2 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CTXN3Q4LDR2 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CTXN3Q4LDR2 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CTXN3Q4LDR2 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CTXN3Q4LDR2 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CTXN3Q4LDR2 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CTXN3Q4LDR2 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CTXN3Q4LDR2 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CTXN3Q4LDR2 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CTXN3Q4LDR2 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CTXN3Q4LDR2 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CTXN3Q4LDR2 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CTXN3Q4LDR2 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CTXN3Q4LDR2 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CTXN3Q4LDR2 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CTXN3Q4LDR2 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CTXN3Q4LDR2 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CTXN3Q4LDR2 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CTXN3Q4LDR2 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CTXN3Q4LDR2 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CTXN3Q4LDR2 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CTXN3Q4LDR2 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CTXN3Q4LDR2 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CTXN3Q4LDR2 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CTXN3Q4LDR2 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
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