Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDE5

SVEP1, Sushi, von Willebrand factor type A, EGF and pentraxin domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 3,571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SVEP1Q4LDE5 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
SVEP1Q4LDE5 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SVEP1Q4LDE5 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SVEP1Q4LDE5 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SVEP1Q4LDE5 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SVEP1Q4LDE5 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SVEP1Q4LDE5 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SVEP1Q4LDE5 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SVEP1Q4LDE5 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SVEP1Q4LDE5 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
SVEP1Q4LDE5 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SVEP1Q4LDE5 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SVEP1Q4LDE5 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SVEP1Q4LDE5 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SVEP1Q4LDE5 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SVEP1Q4LDE5 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SVEP1Q4LDE5 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SVEP1Q4LDE5 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SVEP1Q4LDE5 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SVEP1Q4LDE5 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SVEP1Q4LDE5 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SVEP1Q4LDE5 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SVEP1Q4LDE5 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SVEP1Q4LDE5 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SVEP1Q4LDE5 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SVEP1Q4LDE5 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SVEP1Q4LDE5 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SVEP1Q4LDE5 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SVEP1Q4LDE5 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SVEP1Q4LDE5 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SVEP1Q4LDE5 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SVEP1Q4LDE5 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
SVEP1Q4LDE5 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SVEP1Q4LDE5 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SVEP1Q4LDE5 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SVEP1Q4LDE5 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SVEP1Q4LDE5 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SVEP1Q4LDE5 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SVEP1Q4LDE5 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SVEP1Q4LDE5 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SVEP1Q4LDE5 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SVEP1Q4LDE5 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SVEP1Q4LDE5 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SVEP1Q4LDE5 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SVEP1Q4LDE5 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SVEP1Q4LDE5 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SVEP1Q4LDE5 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SVEP1Q4LDE5 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SVEP1Q4LDE5 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SVEP1Q4LDE5 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SVEP1Q4LDE5 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SVEP1Q4LDE5 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SVEP1Q4LDE5 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SVEP1Q4LDE5 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SVEP1Q4LDE5 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SVEP1Q4LDE5 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SVEP1Q4LDE5 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SVEP1Q4LDE5 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SVEP1Q4LDE5 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SVEP1Q4LDE5 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SVEP1Q4LDE5 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SVEP1Q4LDE5 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SVEP1Q4LDE5 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SVEP1Q4LDE5 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SVEP1Q4LDE5 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SVEP1Q4LDE5 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SVEP1Q4LDE5 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SVEP1Q4LDE5 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SVEP1Q4LDE5 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SVEP1Q4LDE5 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SVEP1Q4LDE5 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SVEP1Q4LDE5 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SVEP1Q4LDE5 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SVEP1Q4LDE5 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SVEP1Q4LDE5 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SVEP1Q4LDE5 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SVEP1Q4LDE5 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SVEP1Q4LDE5 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SVEP1Q4LDE5 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SVEP1Q4LDE5 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SVEP1Q4LDE5 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SVEP1Q4LDE5 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SVEP1Q4LDE5 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SVEP1Q4LDE5 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SVEP1Q4LDE5 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SVEP1Q4LDE5 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SVEP1Q4LDE5 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SVEP1Q4LDE5 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SVEP1Q4LDE5 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SVEP1Q4LDE5 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SVEP1Q4LDE5 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SVEP1Q4LDE5 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SVEP1Q4LDE5 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SVEP1Q4LDE5 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SVEP1Q4LDE5 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SVEP1Q4LDE5 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SVEP1Q4LDE5 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SVEP1Q4LDE5 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SVEP1Q4LDE5 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SVEP1Q4LDE5 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms