Protein–RNA interactions for Protein: Q3BBV2

NBPF8, Putative neuroblastoma breakpoint family member 8, humanhuman

Predictions only

Length 869 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBPF8Q3BBV2 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
NBPF8Q3BBV2 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
NBPF8Q3BBV2 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
NBPF8Q3BBV2 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
NBPF8Q3BBV2 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
NBPF8Q3BBV2 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
NBPF8Q3BBV2 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
NBPF8Q3BBV2 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
NBPF8Q3BBV2 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
NBPF8Q3BBV2 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
NBPF8Q3BBV2 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
NBPF8Q3BBV2 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
NBPF8Q3BBV2 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
NBPF8Q3BBV2 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
NBPF8Q3BBV2 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
NBPF8Q3BBV2 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
NBPF8Q3BBV2 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
NBPF8Q3BBV2 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
NBPF8Q3BBV2 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
NBPF8Q3BBV2 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
NBPF8Q3BBV2 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
NBPF8Q3BBV2 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
NBPF8Q3BBV2 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
NBPF8Q3BBV2 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
NBPF8Q3BBV2 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
NBPF8Q3BBV2 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
NBPF8Q3BBV2 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
NBPF8Q3BBV2 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
NBPF8Q3BBV2 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
NBPF8Q3BBV2 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
NBPF8Q3BBV2 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
NBPF8Q3BBV2 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
NBPF8Q3BBV2 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC29.02■■■□□ 2.24
NBPF8Q3BBV2 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
NBPF8Q3BBV2 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
NBPF8Q3BBV2 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
NBPF8Q3BBV2 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
NBPF8Q3BBV2 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
NBPF8Q3BBV2 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
NBPF8Q3BBV2 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
NBPF8Q3BBV2 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
NBPF8Q3BBV2 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
NBPF8Q3BBV2 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
NBPF8Q3BBV2 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
NBPF8Q3BBV2 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
NBPF8Q3BBV2 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
NBPF8Q3BBV2 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
NBPF8Q3BBV2 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
NBPF8Q3BBV2 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
NBPF8Q3BBV2 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
NBPF8Q3BBV2 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
NBPF8Q3BBV2 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
NBPF8Q3BBV2 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
NBPF8Q3BBV2 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC29■■■□□ 2.23
NBPF8Q3BBV2 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
NBPF8Q3BBV2 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
NBPF8Q3BBV2 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
NBPF8Q3BBV2 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
NBPF8Q3BBV2 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
NBPF8Q3BBV2 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
NBPF8Q3BBV2 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
NBPF8Q3BBV2 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
NBPF8Q3BBV2 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
NBPF8Q3BBV2 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
NBPF8Q3BBV2 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
NBPF8Q3BBV2 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
NBPF8Q3BBV2 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
NBPF8Q3BBV2 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
NBPF8Q3BBV2 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
NBPF8Q3BBV2 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
NBPF8Q3BBV2 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
NBPF8Q3BBV2 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
NBPF8Q3BBV2 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
NBPF8Q3BBV2 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
NBPF8Q3BBV2 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
NBPF8Q3BBV2 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
NBPF8Q3BBV2 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
NBPF8Q3BBV2 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
NBPF8Q3BBV2 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
NBPF8Q3BBV2 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
NBPF8Q3BBV2 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
NBPF8Q3BBV2 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC28.98■■■□□ 2.23
NBPF8Q3BBV2 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
NBPF8Q3BBV2 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
NBPF8Q3BBV2 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
NBPF8Q3BBV2 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
NBPF8Q3BBV2 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
NBPF8Q3BBV2 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
NBPF8Q3BBV2 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
NBPF8Q3BBV2 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
NBPF8Q3BBV2 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
NBPF8Q3BBV2 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
NBPF8Q3BBV2 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
NBPF8Q3BBV2 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
NBPF8Q3BBV2 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
NBPF8Q3BBV2 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
NBPF8Q3BBV2 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
NBPF8Q3BBV2 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
NBPF8Q3BBV2 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
NBPF8Q3BBV2 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms