Protein–RNA interactions for Protein: Q2NKQ1

SGSM1, Small G protein signaling modulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGSM1Q2NKQ1 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SGSM1Q2NKQ1 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SGSM1Q2NKQ1 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SGSM1Q2NKQ1 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SGSM1Q2NKQ1 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SGSM1Q2NKQ1 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SGSM1Q2NKQ1 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SGSM1Q2NKQ1 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SGSM1Q2NKQ1 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SGSM1Q2NKQ1 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
SGSM1Q2NKQ1 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SGSM1Q2NKQ1 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SGSM1Q2NKQ1 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
SGSM1Q2NKQ1 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SGSM1Q2NKQ1 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SGSM1Q2NKQ1 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SGSM1Q2NKQ1 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SGSM1Q2NKQ1 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SGSM1Q2NKQ1 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SGSM1Q2NKQ1 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SGSM1Q2NKQ1 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SGSM1Q2NKQ1 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SGSM1Q2NKQ1 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SGSM1Q2NKQ1 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SGSM1Q2NKQ1 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SGSM1Q2NKQ1 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SGSM1Q2NKQ1 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SGSM1Q2NKQ1 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SGSM1Q2NKQ1 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
SGSM1Q2NKQ1 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SGSM1Q2NKQ1 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
SGSM1Q2NKQ1 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
SGSM1Q2NKQ1 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SGSM1Q2NKQ1 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SGSM1Q2NKQ1 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SGSM1Q2NKQ1 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SGSM1Q2NKQ1 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SGSM1Q2NKQ1 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SGSM1Q2NKQ1 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SGSM1Q2NKQ1 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SGSM1Q2NKQ1 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SGSM1Q2NKQ1 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SGSM1Q2NKQ1 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SGSM1Q2NKQ1 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SGSM1Q2NKQ1 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SGSM1Q2NKQ1 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SGSM1Q2NKQ1 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SGSM1Q2NKQ1 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SGSM1Q2NKQ1 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SGSM1Q2NKQ1 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SGSM1Q2NKQ1 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SGSM1Q2NKQ1 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SGSM1Q2NKQ1 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SGSM1Q2NKQ1 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SGSM1Q2NKQ1 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SGSM1Q2NKQ1 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SGSM1Q2NKQ1 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SGSM1Q2NKQ1 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SGSM1Q2NKQ1 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SGSM1Q2NKQ1 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SGSM1Q2NKQ1 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SGSM1Q2NKQ1 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SGSM1Q2NKQ1 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SGSM1Q2NKQ1 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SGSM1Q2NKQ1 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
SGSM1Q2NKQ1 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SGSM1Q2NKQ1 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SGSM1Q2NKQ1 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SGSM1Q2NKQ1 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SGSM1Q2NKQ1 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SGSM1Q2NKQ1 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SGSM1Q2NKQ1 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SGSM1Q2NKQ1 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SGSM1Q2NKQ1 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SGSM1Q2NKQ1 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SGSM1Q2NKQ1 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SGSM1Q2NKQ1 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SGSM1Q2NKQ1 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SGSM1Q2NKQ1 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SGSM1Q2NKQ1 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SGSM1Q2NKQ1 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SGSM1Q2NKQ1 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SGSM1Q2NKQ1 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SGSM1Q2NKQ1 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SGSM1Q2NKQ1 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SGSM1Q2NKQ1 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SGSM1Q2NKQ1 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SGSM1Q2NKQ1 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SGSM1Q2NKQ1 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SGSM1Q2NKQ1 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SGSM1Q2NKQ1 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SGSM1Q2NKQ1 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SGSM1Q2NKQ1 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SGSM1Q2NKQ1 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SGSM1Q2NKQ1 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SGSM1Q2NKQ1 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SGSM1Q2NKQ1 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SGSM1Q2NKQ1 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SGSM1Q2NKQ1 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SGSM1Q2NKQ1 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
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