Protein–RNA interactions for Protein: Q16695

HIST3H3, Histone H3.1t, humanhuman

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIST3H3Q16695 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
HIST3H3Q16695 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HIST3H3Q16695 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HIST3H3Q16695 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HIST3H3Q16695 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HIST3H3Q16695 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
HIST3H3Q16695 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HIST3H3Q16695 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
HIST3H3Q16695 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
HIST3H3Q16695 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HIST3H3Q16695 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HIST3H3Q16695 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HIST3H3Q16695 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HIST3H3Q16695 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HIST3H3Q16695 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HIST3H3Q16695 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HIST3H3Q16695 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HIST3H3Q16695 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HIST3H3Q16695 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HIST3H3Q16695 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HIST3H3Q16695 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HIST3H3Q16695 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HIST3H3Q16695 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HIST3H3Q16695 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
HIST3H3Q16695 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HIST3H3Q16695 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HIST3H3Q16695 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HIST3H3Q16695 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HIST3H3Q16695 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
HIST3H3Q16695 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
HIST3H3Q16695 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HIST3H3Q16695 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HIST3H3Q16695 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HIST3H3Q16695 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HIST3H3Q16695 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HIST3H3Q16695 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HIST3H3Q16695 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HIST3H3Q16695 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HIST3H3Q16695 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HIST3H3Q16695 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HIST3H3Q16695 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HIST3H3Q16695 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HIST3H3Q16695 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HIST3H3Q16695 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HIST3H3Q16695 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HIST3H3Q16695 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HIST3H3Q16695 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HIST3H3Q16695 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HIST3H3Q16695 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HIST3H3Q16695 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HIST3H3Q16695 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HIST3H3Q16695 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HIST3H3Q16695 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
HIST3H3Q16695 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HIST3H3Q16695 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HIST3H3Q16695 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HIST3H3Q16695 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HIST3H3Q16695 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HIST3H3Q16695 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HIST3H3Q16695 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HIST3H3Q16695 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HIST3H3Q16695 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HIST3H3Q16695 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HIST3H3Q16695 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HIST3H3Q16695 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HIST3H3Q16695 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HIST3H3Q16695 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HIST3H3Q16695 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HIST3H3Q16695 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HIST3H3Q16695 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HIST3H3Q16695 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HIST3H3Q16695 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HIST3H3Q16695 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HIST3H3Q16695 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HIST3H3Q16695 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HIST3H3Q16695 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HIST3H3Q16695 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HIST3H3Q16695 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HIST3H3Q16695 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HIST3H3Q16695 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HIST3H3Q16695 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
HIST3H3Q16695 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HIST3H3Q16695 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HIST3H3Q16695 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HIST3H3Q16695 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HIST3H3Q16695 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HIST3H3Q16695 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HIST3H3Q16695 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HIST3H3Q16695 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HIST3H3Q16695 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HIST3H3Q16695 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HIST3H3Q16695 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HIST3H3Q16695 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HIST3H3Q16695 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HIST3H3Q16695 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HIST3H3Q16695 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HIST3H3Q16695 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HIST3H3Q16695 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HIST3H3Q16695 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HIST3H3Q16695 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms