Protein–RNA interactions for Protein: Q16658

FSCN1, Fascin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FSCN1Q16658 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FSCN1Q16658 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FSCN1Q16658 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FSCN1Q16658 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FSCN1Q16658 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FSCN1Q16658 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FSCN1Q16658 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FSCN1Q16658 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FSCN1Q16658 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FSCN1Q16658 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FSCN1Q16658 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FSCN1Q16658 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FSCN1Q16658 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FSCN1Q16658 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FSCN1Q16658 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FSCN1Q16658 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FSCN1Q16658 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FSCN1Q16658 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FSCN1Q16658 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FSCN1Q16658 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FSCN1Q16658 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FSCN1Q16658 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FSCN1Q16658 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FSCN1Q16658 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FSCN1Q16658 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FSCN1Q16658 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FSCN1Q16658 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FSCN1Q16658 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FSCN1Q16658 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FSCN1Q16658 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FSCN1Q16658 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
FSCN1Q16658 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FSCN1Q16658 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FSCN1Q16658 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FSCN1Q16658 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
FSCN1Q16658 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FSCN1Q16658 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FSCN1Q16658 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FSCN1Q16658 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FSCN1Q16658 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FSCN1Q16658 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
FSCN1Q16658 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
FSCN1Q16658 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.23
FSCN1Q16658 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FSCN1Q16658 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FSCN1Q16658 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FSCN1Q16658 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FSCN1Q16658 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FSCN1Q16658 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FSCN1Q16658 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FSCN1Q16658 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FSCN1Q16658 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FSCN1Q16658 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FSCN1Q16658 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FSCN1Q16658 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FSCN1Q16658 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FSCN1Q16658 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FSCN1Q16658 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FSCN1Q16658 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FSCN1Q16658 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FSCN1Q16658 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FSCN1Q16658 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FSCN1Q16658 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FSCN1Q16658 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FSCN1Q16658 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FSCN1Q16658 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FSCN1Q16658 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FSCN1Q16658 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FSCN1Q16658 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FSCN1Q16658 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
FSCN1Q16658 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FSCN1Q16658 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FSCN1Q16658 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FSCN1Q16658 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FSCN1Q16658 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FSCN1Q16658 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FSCN1Q16658 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FSCN1Q16658 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FSCN1Q16658 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FSCN1Q16658 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FSCN1Q16658 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FSCN1Q16658 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FSCN1Q16658 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FSCN1Q16658 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FSCN1Q16658 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FSCN1Q16658 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FSCN1Q16658 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FSCN1Q16658 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FSCN1Q16658 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
FSCN1Q16658 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FSCN1Q16658 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FSCN1Q16658 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FSCN1Q16658 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FSCN1Q16658 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FSCN1Q16658 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FSCN1Q16658 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FSCN1Q16658 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
FSCN1Q16658 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FSCN1Q16658 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
FSCN1Q16658 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms