Protein–RNA interactions for Protein: Q16563

SYPL1, Synaptophysin-like protein 1, humanhuman

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Length 259 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYPL1Q16563 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SYPL1Q16563 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SYPL1Q16563 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SYPL1Q16563 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SYPL1Q16563 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SYPL1Q16563 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SYPL1Q16563 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SYPL1Q16563 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SYPL1Q16563 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SYPL1Q16563 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SYPL1Q16563 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SYPL1Q16563 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SYPL1Q16563 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SYPL1Q16563 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SYPL1Q16563 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SYPL1Q16563 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SYPL1Q16563 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SYPL1Q16563 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
SYPL1Q16563 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SYPL1Q16563 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SYPL1Q16563 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SYPL1Q16563 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SYPL1Q16563 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SYPL1Q16563 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
SYPL1Q16563 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SYPL1Q16563 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SYPL1Q16563 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SYPL1Q16563 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SYPL1Q16563 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SYPL1Q16563 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SYPL1Q16563 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SYPL1Q16563 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SYPL1Q16563 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SYPL1Q16563 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SYPL1Q16563 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SYPL1Q16563 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SYPL1Q16563 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SYPL1Q16563 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SYPL1Q16563 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SYPL1Q16563 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
SYPL1Q16563 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SYPL1Q16563 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SYPL1Q16563 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SYPL1Q16563 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SYPL1Q16563 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SYPL1Q16563 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SYPL1Q16563 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SYPL1Q16563 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SYPL1Q16563 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SYPL1Q16563 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SYPL1Q16563 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SYPL1Q16563 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SYPL1Q16563 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SYPL1Q16563 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SYPL1Q16563 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SYPL1Q16563 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
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SYPL1Q16563 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SYPL1Q16563 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SYPL1Q16563 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SYPL1Q16563 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SYPL1Q16563 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SYPL1Q16563 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SYPL1Q16563 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SYPL1Q16563 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SYPL1Q16563 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SYPL1Q16563 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SYPL1Q16563 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SYPL1Q16563 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SYPL1Q16563 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SYPL1Q16563 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SYPL1Q16563 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SYPL1Q16563 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SYPL1Q16563 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SYPL1Q16563 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SYPL1Q16563 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SYPL1Q16563 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SYPL1Q16563 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SYPL1Q16563 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SYPL1Q16563 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SYPL1Q16563 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SYPL1Q16563 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SYPL1Q16563 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SYPL1Q16563 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SYPL1Q16563 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SYPL1Q16563 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SYPL1Q16563 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SYPL1Q16563 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SYPL1Q16563 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SYPL1Q16563 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SYPL1Q16563 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SYPL1Q16563 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SYPL1Q16563 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
SYPL1Q16563 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SYPL1Q16563 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
SYPL1Q16563 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
SYPL1Q16563 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SYPL1Q16563 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
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