Protein–RNA interactions for Protein: Q16527

CSRP2, Cysteine and glycine-rich protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRP2Q16527 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CSRP2Q16527 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CSRP2Q16527 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CSRP2Q16527 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CSRP2Q16527 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CSRP2Q16527 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CSRP2Q16527 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CSRP2Q16527 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CSRP2Q16527 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CSRP2Q16527 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CSRP2Q16527 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CSRP2Q16527 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CSRP2Q16527 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CSRP2Q16527 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CSRP2Q16527 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CSRP2Q16527 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CSRP2Q16527 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CSRP2Q16527 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CSRP2Q16527 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CSRP2Q16527 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CSRP2Q16527 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CSRP2Q16527 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CSRP2Q16527 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CSRP2Q16527 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CSRP2Q16527 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CSRP2Q16527 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CSRP2Q16527 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CSRP2Q16527 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CSRP2Q16527 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CSRP2Q16527 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CSRP2Q16527 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CSRP2Q16527 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CSRP2Q16527 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CSRP2Q16527 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CSRP2Q16527 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CSRP2Q16527 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CSRP2Q16527 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CSRP2Q16527 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CSRP2Q16527 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CSRP2Q16527 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CSRP2Q16527 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CSRP2Q16527 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CSRP2Q16527 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
CSRP2Q16527 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
CSRP2Q16527 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CSRP2Q16527 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CSRP2Q16527 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CSRP2Q16527 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CSRP2Q16527 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CSRP2Q16527 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CSRP2Q16527 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CSRP2Q16527 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CSRP2Q16527 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CSRP2Q16527 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CSRP2Q16527 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CSRP2Q16527 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
CSRP2Q16527 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CSRP2Q16527 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CSRP2Q16527 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
CSRP2Q16527 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CSRP2Q16527 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CSRP2Q16527 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CSRP2Q16527 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CSRP2Q16527 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CSRP2Q16527 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
CSRP2Q16527 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
CSRP2Q16527 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CSRP2Q16527 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CSRP2Q16527 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CSRP2Q16527 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CSRP2Q16527 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CSRP2Q16527 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CSRP2Q16527 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CSRP2Q16527 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CSRP2Q16527 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
CSRP2Q16527 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CSRP2Q16527 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CSRP2Q16527 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CSRP2Q16527 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CSRP2Q16527 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CSRP2Q16527 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CSRP2Q16527 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CSRP2Q16527 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CSRP2Q16527 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CSRP2Q16527 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CSRP2Q16527 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CSRP2Q16527 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CSRP2Q16527 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CSRP2Q16527 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CSRP2Q16527 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CSRP2Q16527 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CSRP2Q16527 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CSRP2Q16527 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CSRP2Q16527 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CSRP2Q16527 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CSRP2Q16527 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
CSRP2Q16527 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
CSRP2Q16527 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CSRP2Q16527 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CSRP2Q16527 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms