Protein–RNA interactions for Protein: Q16518

RPE65, Retinoid isomerohydrolase, humanhuman

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Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPE65Q16518 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
RPE65Q16518 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
RPE65Q16518 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
RPE65Q16518 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
RPE65Q16518 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
RPE65Q16518 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
RPE65Q16518 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
RPE65Q16518 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
RPE65Q16518 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
RPE65Q16518 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
RPE65Q16518 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
RPE65Q16518 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
RPE65Q16518 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
RPE65Q16518 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
RPE65Q16518 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
RPE65Q16518 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
RPE65Q16518 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
RPE65Q16518 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
RPE65Q16518 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
RPE65Q16518 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
RPE65Q16518 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
RPE65Q16518 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
RPE65Q16518 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC19.78■□□□□ 0.76
RPE65Q16518 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
RPE65Q16518 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
RPE65Q16518 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.78■□□□□ 0.76
RPE65Q16518 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
RPE65Q16518 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
RPE65Q16518 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
RPE65Q16518 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
RPE65Q16518 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
RPE65Q16518 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
RPE65Q16518 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
RPE65Q16518 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
RPE65Q16518 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
RPE65Q16518 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
RPE65Q16518 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
RPE65Q16518 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
RPE65Q16518 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
RPE65Q16518 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
RPE65Q16518 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
RPE65Q16518 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
RPE65Q16518 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
RPE65Q16518 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
RPE65Q16518 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
RPE65Q16518 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
RPE65Q16518 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC19.77■□□□□ 0.76
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RPE65Q16518 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
RPE65Q16518 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
RPE65Q16518 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
RPE65Q16518 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.75
RPE65Q16518 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
RPE65Q16518 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
RPE65Q16518 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
RPE65Q16518 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
RPE65Q16518 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
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RPE65Q16518 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
RPE65Q16518 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
RPE65Q16518 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
RPE65Q16518 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
RPE65Q16518 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
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RPE65Q16518 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
RPE65Q16518 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
RPE65Q16518 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
RPE65Q16518 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
RPE65Q16518 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
RPE65Q16518 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
RPE65Q16518 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
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RPE65Q16518 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
RPE65Q16518 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC19.76■□□□□ 0.75
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RPE65Q16518 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
RPE65Q16518 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
RPE65Q16518 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
RPE65Q16518 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
RPE65Q16518 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
RPE65Q16518 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
RPE65Q16518 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
RPE65Q16518 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
RPE65Q16518 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
RPE65Q16518 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC19.75■□□□□ 0.75
RPE65Q16518 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
RPE65Q16518 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
RPE65Q16518 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
RPE65Q16518 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
RPE65Q16518 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
RPE65Q16518 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
RPE65Q16518 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
RPE65Q16518 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
RPE65Q16518 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
RPE65Q16518 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
RPE65Q16518 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
RPE65Q16518 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
RPE65Q16518 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
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