Protein–RNA interactions for Protein: Q15788

NCOA1, Nuclear receptor coactivator 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA1Q15788 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC30.62■■■□□ 2.49
NCOA1Q15788 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
NCOA1Q15788 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC30.62■■■□□ 2.49
NCOA1Q15788 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
NCOA1Q15788 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC30.62■■■□□ 2.49
NCOA1Q15788 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
NCOA1Q15788 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
NCOA1Q15788 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
NCOA1Q15788 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
NCOA1Q15788 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
NCOA1Q15788 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
NCOA1Q15788 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
NCOA1Q15788 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
NCOA1Q15788 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
NCOA1Q15788 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
NCOA1Q15788 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
NCOA1Q15788 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
NCOA1Q15788 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC30.61■■■□□ 2.49
NCOA1Q15788 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.61■■■□□ 2.49
NCOA1Q15788 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
NCOA1Q15788 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.61■■■□□ 2.49
NCOA1Q15788 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC30.6■■■□□ 2.49
NCOA1Q15788 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
NCOA1Q15788 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC30.6■■■□□ 2.49
NCOA1Q15788 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC30.6■■■□□ 2.49
NCOA1Q15788 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
NCOA1Q15788 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
NCOA1Q15788 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.6■■■□□ 2.49
NCOA1Q15788 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
NCOA1Q15788 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC30.59■■■□□ 2.49
NCOA1Q15788 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
NCOA1Q15788 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
NCOA1Q15788 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
NCOA1Q15788 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC30.59■■■□□ 2.49
NCOA1Q15788 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
NCOA1Q15788 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
NCOA1Q15788 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
NCOA1Q15788 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
NCOA1Q15788 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
NCOA1Q15788 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
NCOA1Q15788 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
NCOA1Q15788 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
NCOA1Q15788 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC30.58■■■□□ 2.49
NCOA1Q15788 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
NCOA1Q15788 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
NCOA1Q15788 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
NCOA1Q15788 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
NCOA1Q15788 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
NCOA1Q15788 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
NCOA1Q15788 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
NCOA1Q15788 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
NCOA1Q15788 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
NCOA1Q15788 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
NCOA1Q15788 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
NCOA1Q15788 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
NCOA1Q15788 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
NCOA1Q15788 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
NCOA1Q15788 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
NCOA1Q15788 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
NCOA1Q15788 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
NCOA1Q15788 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
NCOA1Q15788 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
NCOA1Q15788 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
NCOA1Q15788 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
NCOA1Q15788 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
NCOA1Q15788 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC30.56■■■□□ 2.48
NCOA1Q15788 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
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NCOA1Q15788 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
NCOA1Q15788 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
NCOA1Q15788 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
NCOA1Q15788 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
NCOA1Q15788 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
NCOA1Q15788 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
NCOA1Q15788 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
NCOA1Q15788 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
NCOA1Q15788 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
NCOA1Q15788 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
NCOA1Q15788 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
NCOA1Q15788 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
NCOA1Q15788 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
NCOA1Q15788 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
NCOA1Q15788 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
NCOA1Q15788 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
NCOA1Q15788 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
NCOA1Q15788 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
NCOA1Q15788 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
NCOA1Q15788 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC30.55■■■□□ 2.48
NCOA1Q15788 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC30.55■■■□□ 2.48
NCOA1Q15788 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
NCOA1Q15788 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
NCOA1Q15788 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
NCOA1Q15788 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
NCOA1Q15788 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
NCOA1Q15788 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
NCOA1Q15788 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
NCOA1Q15788 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC30.54■■■□□ 2.48
NCOA1Q15788 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
NCOA1Q15788 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
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