Protein–RNA interactions for Protein: Q15649

ZNHIT3, Zinc finger HIT domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 155 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNHIT3Q15649 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
ZNHIT3Q15649 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ZNHIT3Q15649 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC19■□□□□ 0.63
ZNHIT3Q15649 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC19■□□□□ 0.63
ZNHIT3Q15649 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ZNHIT3Q15649 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ZNHIT3Q15649 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ZNHIT3Q15649 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ZNHIT3Q15649 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ZNHIT3Q15649 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
ZNHIT3Q15649 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ZNHIT3Q15649 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
ZNHIT3Q15649 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ZNHIT3Q15649 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
ZNHIT3Q15649 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
ZNHIT3Q15649 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
ZNHIT3Q15649 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ZNHIT3Q15649 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ZNHIT3Q15649 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ZNHIT3Q15649 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ZNHIT3Q15649 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
ZNHIT3Q15649 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ZNHIT3Q15649 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ZNHIT3Q15649 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ZNHIT3Q15649 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
ZNHIT3Q15649 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ZNHIT3Q15649 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ZNHIT3Q15649 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ZNHIT3Q15649 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ZNHIT3Q15649 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ZNHIT3Q15649 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ZNHIT3Q15649 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ZNHIT3Q15649 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
ZNHIT3Q15649 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ZNHIT3Q15649 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
ZNHIT3Q15649 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ZNHIT3Q15649 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ZNHIT3Q15649 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ZNHIT3Q15649 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ZNHIT3Q15649 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ZNHIT3Q15649 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ZNHIT3Q15649 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ZNHIT3Q15649 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ZNHIT3Q15649 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ZNHIT3Q15649 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ZNHIT3Q15649 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ZNHIT3Q15649 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ZNHIT3Q15649 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ZNHIT3Q15649 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
ZNHIT3Q15649 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ZNHIT3Q15649 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ZNHIT3Q15649 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ZNHIT3Q15649 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ZNHIT3Q15649 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ZNHIT3Q15649 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ZNHIT3Q15649 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ZNHIT3Q15649 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ZNHIT3Q15649 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ZNHIT3Q15649 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ZNHIT3Q15649 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ZNHIT3Q15649 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ZNHIT3Q15649 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ZNHIT3Q15649 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ZNHIT3Q15649 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ZNHIT3Q15649 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ZNHIT3Q15649 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
ZNHIT3Q15649 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ZNHIT3Q15649 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ZNHIT3Q15649 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
ZNHIT3Q15649 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ZNHIT3Q15649 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ZNHIT3Q15649 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ZNHIT3Q15649 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ZNHIT3Q15649 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ZNHIT3Q15649 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ZNHIT3Q15649 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ZNHIT3Q15649 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ZNHIT3Q15649 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ZNHIT3Q15649 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ZNHIT3Q15649 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ZNHIT3Q15649 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ZNHIT3Q15649 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ZNHIT3Q15649 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ZNHIT3Q15649 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ZNHIT3Q15649 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
ZNHIT3Q15649 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ZNHIT3Q15649 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ZNHIT3Q15649 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ZNHIT3Q15649 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ZNHIT3Q15649 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ZNHIT3Q15649 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ZNHIT3Q15649 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ZNHIT3Q15649 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ZNHIT3Q15649 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ZNHIT3Q15649 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ZNHIT3Q15649 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ZNHIT3Q15649 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ZNHIT3Q15649 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ZNHIT3Q15649 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ZNHIT3Q15649 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.5 ms