Protein–RNA interactions for Protein: Q15637

SF1, Splicing factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 639 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF1Q15637 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SF1Q15637 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SF1Q15637 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
SF1Q15637 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SF1Q15637 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SF1Q15637 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SF1Q15637 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SF1Q15637 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SF1Q15637 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SF1Q15637 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SF1Q15637 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SF1Q15637 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
SF1Q15637 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SF1Q15637 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SF1Q15637 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SF1Q15637 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
SF1Q15637 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SF1Q15637 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SF1Q15637 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SF1Q15637 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SF1Q15637 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SF1Q15637 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SF1Q15637 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SF1Q15637 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SF1Q15637 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SF1Q15637 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SF1Q15637 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SF1Q15637 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SF1Q15637 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SF1Q15637 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SF1Q15637 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SF1Q15637 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SF1Q15637 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SF1Q15637 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SF1Q15637 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
SF1Q15637 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SF1Q15637 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SF1Q15637 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SF1Q15637 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SF1Q15637 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SF1Q15637 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SF1Q15637 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SF1Q15637 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SF1Q15637 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SF1Q15637 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SF1Q15637 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SF1Q15637 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SF1Q15637 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SF1Q15637 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SF1Q15637 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SF1Q15637 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SF1Q15637 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SF1Q15637 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
SF1Q15637 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SF1Q15637 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SF1Q15637 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
SF1Q15637 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SF1Q15637 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SF1Q15637 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SF1Q15637 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SF1Q15637 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SF1Q15637 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SF1Q15637 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SF1Q15637 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SF1Q15637 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SF1Q15637 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SF1Q15637 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SF1Q15637 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SF1Q15637 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SF1Q15637 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SF1Q15637 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SF1Q15637 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SF1Q15637 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SF1Q15637 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SF1Q15637 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SF1Q15637 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SF1Q15637 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SF1Q15637 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SF1Q15637 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SF1Q15637 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SF1Q15637 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SF1Q15637 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SF1Q15637 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SF1Q15637 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SF1Q15637 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SF1Q15637 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SF1Q15637 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SF1Q15637 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SF1Q15637 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SF1Q15637 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SF1Q15637 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SF1Q15637 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SF1Q15637 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SF1Q15637 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SF1Q15637 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SF1Q15637 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SF1Q15637 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SF1Q15637 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SF1Q15637 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SF1Q15637 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
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