Protein–RNA interactions for Protein: Q15397

PUM3, Pumilio homolog 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 648 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUM3Q15397 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PUM3Q15397 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PUM3Q15397 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PUM3Q15397 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
PUM3Q15397 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PUM3Q15397 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PUM3Q15397 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PUM3Q15397 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PUM3Q15397 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PUM3Q15397 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PUM3Q15397 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PUM3Q15397 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PUM3Q15397 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
PUM3Q15397 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PUM3Q15397 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PUM3Q15397 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PUM3Q15397 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PUM3Q15397 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PUM3Q15397 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PUM3Q15397 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PUM3Q15397 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PUM3Q15397 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PUM3Q15397 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
PUM3Q15397 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
PUM3Q15397 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PUM3Q15397 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PUM3Q15397 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PUM3Q15397 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PUM3Q15397 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PUM3Q15397 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
PUM3Q15397 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PUM3Q15397 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PUM3Q15397 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PUM3Q15397 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PUM3Q15397 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PUM3Q15397 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PUM3Q15397 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PUM3Q15397 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PUM3Q15397 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PUM3Q15397 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
PUM3Q15397 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
PUM3Q15397 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PUM3Q15397 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PUM3Q15397 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
PUM3Q15397 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PUM3Q15397 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PUM3Q15397 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PUM3Q15397 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PUM3Q15397 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PUM3Q15397 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PUM3Q15397 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PUM3Q15397 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PUM3Q15397 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PUM3Q15397 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PUM3Q15397 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PUM3Q15397 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PUM3Q15397 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PUM3Q15397 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PUM3Q15397 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PUM3Q15397 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PUM3Q15397 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PUM3Q15397 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PUM3Q15397 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PUM3Q15397 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PUM3Q15397 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PUM3Q15397 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PUM3Q15397 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PUM3Q15397 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PUM3Q15397 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PUM3Q15397 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PUM3Q15397 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PUM3Q15397 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PUM3Q15397 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PUM3Q15397 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PUM3Q15397 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PUM3Q15397 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PUM3Q15397 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PUM3Q15397 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PUM3Q15397 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PUM3Q15397 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PUM3Q15397 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
PUM3Q15397 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PUM3Q15397 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PUM3Q15397 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PUM3Q15397 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PUM3Q15397 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PUM3Q15397 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PUM3Q15397 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PUM3Q15397 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PUM3Q15397 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PUM3Q15397 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PUM3Q15397 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PUM3Q15397 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PUM3Q15397 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PUM3Q15397 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PUM3Q15397 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PUM3Q15397 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PUM3Q15397 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PUM3Q15397 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PUM3Q15397 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
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