Protein–RNA interactions for Protein: Q149N8

SHPRH, E3 ubiquitin-protein ligase SHPRH, humanhuman

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Length 1,683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHPRHQ149N8 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SHPRHQ149N8 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SHPRHQ149N8 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SHPRHQ149N8 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SHPRHQ149N8 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SHPRHQ149N8 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SHPRHQ149N8 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SHPRHQ149N8 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SHPRHQ149N8 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SHPRHQ149N8 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SHPRHQ149N8 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SHPRHQ149N8 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SHPRHQ149N8 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SHPRHQ149N8 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
SHPRHQ149N8 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
SHPRHQ149N8 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
SHPRHQ149N8 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
SHPRHQ149N8 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
SHPRHQ149N8 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
SHPRHQ149N8 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
SHPRHQ149N8 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
SHPRHQ149N8 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SHPRHQ149N8 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
SHPRHQ149N8 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
SHPRHQ149N8 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SHPRHQ149N8 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SHPRHQ149N8 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
SHPRHQ149N8 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SHPRHQ149N8 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SHPRHQ149N8 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SHPRHQ149N8 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SHPRHQ149N8 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SHPRHQ149N8 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SHPRHQ149N8 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SHPRHQ149N8 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SHPRHQ149N8 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SHPRHQ149N8 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SHPRHQ149N8 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
SHPRHQ149N8 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SHPRHQ149N8 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
SHPRHQ149N8 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SHPRHQ149N8 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SHPRHQ149N8 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SHPRHQ149N8 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SHPRHQ149N8 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SHPRHQ149N8 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SHPRHQ149N8 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SHPRHQ149N8 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SHPRHQ149N8 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SHPRHQ149N8 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SHPRHQ149N8 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SHPRHQ149N8 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SHPRHQ149N8 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SHPRHQ149N8 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SHPRHQ149N8 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SHPRHQ149N8 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SHPRHQ149N8 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SHPRHQ149N8 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SHPRHQ149N8 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SHPRHQ149N8 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SHPRHQ149N8 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SHPRHQ149N8 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SHPRHQ149N8 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SHPRHQ149N8 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SHPRHQ149N8 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SHPRHQ149N8 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SHPRHQ149N8 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SHPRHQ149N8 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
SHPRHQ149N8 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SHPRHQ149N8 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SHPRHQ149N8 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SHPRHQ149N8 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SHPRHQ149N8 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SHPRHQ149N8 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SHPRHQ149N8 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SHPRHQ149N8 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SHPRHQ149N8 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SHPRHQ149N8 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SHPRHQ149N8 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SHPRHQ149N8 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SHPRHQ149N8 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SHPRHQ149N8 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SHPRHQ149N8 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SHPRHQ149N8 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SHPRHQ149N8 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SHPRHQ149N8 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SHPRHQ149N8 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SHPRHQ149N8 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
SHPRHQ149N8 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SHPRHQ149N8 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SHPRHQ149N8 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
SHPRHQ149N8 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SHPRHQ149N8 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SHPRHQ149N8 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SHPRHQ149N8 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SHPRHQ149N8 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SHPRHQ149N8 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
SHPRHQ149N8 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SHPRHQ149N8 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
SHPRHQ149N8 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
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