Protein–RNA interactions for Protein: Q14956

GPNMB, Transmembrane glycoprotein NMB, humanhuman

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPNMBQ14956 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GPNMBQ14956 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GPNMBQ14956 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GPNMBQ14956 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GPNMBQ14956 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GPNMBQ14956 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GPNMBQ14956 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GPNMBQ14956 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GPNMBQ14956 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GPNMBQ14956 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GPNMBQ14956 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GPNMBQ14956 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GPNMBQ14956 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GPNMBQ14956 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GPNMBQ14956 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GPNMBQ14956 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GPNMBQ14956 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GPNMBQ14956 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GPNMBQ14956 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GPNMBQ14956 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GPNMBQ14956 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GPNMBQ14956 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GPNMBQ14956 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GPNMBQ14956 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GPNMBQ14956 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GPNMBQ14956 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GPNMBQ14956 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GPNMBQ14956 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GPNMBQ14956 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GPNMBQ14956 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GPNMBQ14956 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GPNMBQ14956 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GPNMBQ14956 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GPNMBQ14956 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GPNMBQ14956 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GPNMBQ14956 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GPNMBQ14956 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GPNMBQ14956 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GPNMBQ14956 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GPNMBQ14956 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GPNMBQ14956 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GPNMBQ14956 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GPNMBQ14956 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GPNMBQ14956 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GPNMBQ14956 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GPNMBQ14956 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
GPNMBQ14956 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GPNMBQ14956 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GPNMBQ14956 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GPNMBQ14956 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GPNMBQ14956 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GPNMBQ14956 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GPNMBQ14956 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GPNMBQ14956 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GPNMBQ14956 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GPNMBQ14956 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GPNMBQ14956 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GPNMBQ14956 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GPNMBQ14956 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
GPNMBQ14956 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
GPNMBQ14956 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GPNMBQ14956 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GPNMBQ14956 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GPNMBQ14956 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GPNMBQ14956 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GPNMBQ14956 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GPNMBQ14956 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GPNMBQ14956 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GPNMBQ14956 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GPNMBQ14956 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GPNMBQ14956 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
GPNMBQ14956 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GPNMBQ14956 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GPNMBQ14956 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GPNMBQ14956 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GPNMBQ14956 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GPNMBQ14956 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GPNMBQ14956 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GPNMBQ14956 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GPNMBQ14956 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GPNMBQ14956 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GPNMBQ14956 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GPNMBQ14956 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GPNMBQ14956 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GPNMBQ14956 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GPNMBQ14956 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GPNMBQ14956 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GPNMBQ14956 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GPNMBQ14956 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GPNMBQ14956 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GPNMBQ14956 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GPNMBQ14956 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GPNMBQ14956 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
GPNMBQ14956 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GPNMBQ14956 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GPNMBQ14956 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GPNMBQ14956 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GPNMBQ14956 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GPNMBQ14956 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
GPNMBQ14956 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms