Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 214 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SMCO1Q147U7 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SMCO1Q147U7 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SMCO1Q147U7 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SMCO1Q147U7 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SMCO1Q147U7 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SMCO1Q147U7 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SMCO1Q147U7 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SMCO1Q147U7 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SMCO1Q147U7 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SMCO1Q147U7 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SMCO1Q147U7 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SMCO1Q147U7 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SMCO1Q147U7 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SMCO1Q147U7 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SMCO1Q147U7 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SMCO1Q147U7 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SMCO1Q147U7 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SMCO1Q147U7 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SMCO1Q147U7 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SMCO1Q147U7 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SMCO1Q147U7 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SMCO1Q147U7 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SMCO1Q147U7 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SMCO1Q147U7 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SMCO1Q147U7 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SMCO1Q147U7 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SMCO1Q147U7 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SMCO1Q147U7 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SMCO1Q147U7 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SMCO1Q147U7 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SMCO1Q147U7 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SMCO1Q147U7 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SMCO1Q147U7 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SMCO1Q147U7 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SMCO1Q147U7 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SMCO1Q147U7 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SMCO1Q147U7 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SMCO1Q147U7 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SMCO1Q147U7 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SMCO1Q147U7 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SMCO1Q147U7 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SMCO1Q147U7 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SMCO1Q147U7 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SMCO1Q147U7 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SMCO1Q147U7 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SMCO1Q147U7 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SMCO1Q147U7 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SMCO1Q147U7 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SMCO1Q147U7 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SMCO1Q147U7 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SMCO1Q147U7 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SMCO1Q147U7 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SMCO1Q147U7 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SMCO1Q147U7 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SMCO1Q147U7 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SMCO1Q147U7 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SMCO1Q147U7 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SMCO1Q147U7 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SMCO1Q147U7 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SMCO1Q147U7 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SMCO1Q147U7 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SMCO1Q147U7 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SMCO1Q147U7 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SMCO1Q147U7 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SMCO1Q147U7 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
SMCO1Q147U7 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SMCO1Q147U7 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
SMCO1Q147U7 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SMCO1Q147U7 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SMCO1Q147U7 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SMCO1Q147U7 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
SMCO1Q147U7 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
SMCO1Q147U7 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SMCO1Q147U7 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
SMCO1Q147U7 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
SMCO1Q147U7 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
SMCO1Q147U7 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SMCO1Q147U7 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SMCO1Q147U7 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SMCO1Q147U7 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SMCO1Q147U7 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SMCO1Q147U7 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SMCO1Q147U7 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SMCO1Q147U7 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SMCO1Q147U7 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SMCO1Q147U7 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SMCO1Q147U7 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
SMCO1Q147U7 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
SMCO1Q147U7 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SMCO1Q147U7 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SMCO1Q147U7 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SMCO1Q147U7 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SMCO1Q147U7 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SMCO1Q147U7 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SMCO1Q147U7 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SMCO1Q147U7 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SMCO1Q147U7 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SMCO1Q147U7 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SMCO1Q147U7 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
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