Protein–RNA interactions for Protein: Q14213

EBI3, Interleukin-27 subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBI3Q14213 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
EBI3Q14213 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
EBI3Q14213 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
EBI3Q14213 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
EBI3Q14213 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
EBI3Q14213 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
EBI3Q14213 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
EBI3Q14213 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
EBI3Q14213 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
EBI3Q14213 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
EBI3Q14213 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
EBI3Q14213 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
EBI3Q14213 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
EBI3Q14213 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
EBI3Q14213 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
EBI3Q14213 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
EBI3Q14213 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
EBI3Q14213 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
EBI3Q14213 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
EBI3Q14213 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
EBI3Q14213 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
EBI3Q14213 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
EBI3Q14213 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
EBI3Q14213 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EBI3Q14213 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EBI3Q14213 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
EBI3Q14213 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EBI3Q14213 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
EBI3Q14213 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EBI3Q14213 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
EBI3Q14213 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
EBI3Q14213 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
EBI3Q14213 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
EBI3Q14213 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
EBI3Q14213 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EBI3Q14213 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
EBI3Q14213 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
EBI3Q14213 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
EBI3Q14213 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
EBI3Q14213 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
EBI3Q14213 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
EBI3Q14213 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
EBI3Q14213 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
EBI3Q14213 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EBI3Q14213 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
EBI3Q14213 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EBI3Q14213 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
EBI3Q14213 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
EBI3Q14213 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EBI3Q14213 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
EBI3Q14213 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EBI3Q14213 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EBI3Q14213 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
EBI3Q14213 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EBI3Q14213 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EBI3Q14213 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EBI3Q14213 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
EBI3Q14213 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
EBI3Q14213 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EBI3Q14213 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EBI3Q14213 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EBI3Q14213 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
EBI3Q14213 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EBI3Q14213 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
EBI3Q14213 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
EBI3Q14213 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
EBI3Q14213 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
EBI3Q14213 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
EBI3Q14213 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
EBI3Q14213 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EBI3Q14213 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
EBI3Q14213 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EBI3Q14213 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
EBI3Q14213 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
EBI3Q14213 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
EBI3Q14213 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EBI3Q14213 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EBI3Q14213 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EBI3Q14213 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
EBI3Q14213 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
EBI3Q14213 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
EBI3Q14213 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EBI3Q14213 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EBI3Q14213 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
EBI3Q14213 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
EBI3Q14213 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
EBI3Q14213 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
EBI3Q14213 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EBI3Q14213 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
EBI3Q14213 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EBI3Q14213 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
EBI3Q14213 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
EBI3Q14213 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
EBI3Q14213 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EBI3Q14213 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EBI3Q14213 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EBI3Q14213 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EBI3Q14213 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
EBI3Q14213 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EBI3Q14213 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
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