Protein–RNA interactions for Protein: Q14162

SCARF1, Scavenger receptor class F member 1, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARF1Q14162 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SCARF1Q14162 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SCARF1Q14162 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SCARF1Q14162 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SCARF1Q14162 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SCARF1Q14162 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SCARF1Q14162 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SCARF1Q14162 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SCARF1Q14162 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SCARF1Q14162 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SCARF1Q14162 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SCARF1Q14162 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
SCARF1Q14162 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SCARF1Q14162 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
SCARF1Q14162 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
SCARF1Q14162 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SCARF1Q14162 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SCARF1Q14162 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SCARF1Q14162 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
SCARF1Q14162 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SCARF1Q14162 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
SCARF1Q14162 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SCARF1Q14162 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SCARF1Q14162 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SCARF1Q14162 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SCARF1Q14162 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
SCARF1Q14162 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SCARF1Q14162 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SCARF1Q14162 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SCARF1Q14162 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SCARF1Q14162 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SCARF1Q14162 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SCARF1Q14162 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SCARF1Q14162 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SCARF1Q14162 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SCARF1Q14162 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SCARF1Q14162 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SCARF1Q14162 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SCARF1Q14162 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SCARF1Q14162 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
SCARF1Q14162 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
SCARF1Q14162 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SCARF1Q14162 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
SCARF1Q14162 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SCARF1Q14162 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SCARF1Q14162 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SCARF1Q14162 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
SCARF1Q14162 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SCARF1Q14162 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SCARF1Q14162 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SCARF1Q14162 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SCARF1Q14162 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
SCARF1Q14162 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SCARF1Q14162 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SCARF1Q14162 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SCARF1Q14162 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SCARF1Q14162 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SCARF1Q14162 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SCARF1Q14162 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SCARF1Q14162 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SCARF1Q14162 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SCARF1Q14162 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SCARF1Q14162 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SCARF1Q14162 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SCARF1Q14162 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SCARF1Q14162 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SCARF1Q14162 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SCARF1Q14162 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SCARF1Q14162 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SCARF1Q14162 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SCARF1Q14162 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SCARF1Q14162 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
SCARF1Q14162 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SCARF1Q14162 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
SCARF1Q14162 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SCARF1Q14162 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SCARF1Q14162 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SCARF1Q14162 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SCARF1Q14162 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SCARF1Q14162 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SCARF1Q14162 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SCARF1Q14162 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SCARF1Q14162 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SCARF1Q14162 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SCARF1Q14162 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SCARF1Q14162 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SCARF1Q14162 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SCARF1Q14162 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SCARF1Q14162 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SCARF1Q14162 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SCARF1Q14162 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SCARF1Q14162 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SCARF1Q14162 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SCARF1Q14162 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SCARF1Q14162 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
SCARF1Q14162 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SCARF1Q14162 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SCARF1Q14162 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SCARF1Q14162 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SCARF1Q14162 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
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