Protein–RNA interactions for Protein: Q14008

CKAP5, Cytoskeleton-associated protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 2,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP5Q14008 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CKAP5Q14008 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CKAP5Q14008 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CKAP5Q14008 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CKAP5Q14008 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CKAP5Q14008 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CKAP5Q14008 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CKAP5Q14008 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CKAP5Q14008 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CKAP5Q14008 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CKAP5Q14008 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CKAP5Q14008 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CKAP5Q14008 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CKAP5Q14008 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CKAP5Q14008 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CKAP5Q14008 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CKAP5Q14008 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CKAP5Q14008 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CKAP5Q14008 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CKAP5Q14008 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CKAP5Q14008 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CKAP5Q14008 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CKAP5Q14008 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CKAP5Q14008 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CKAP5Q14008 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CKAP5Q14008 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CKAP5Q14008 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CKAP5Q14008 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CKAP5Q14008 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CKAP5Q14008 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CKAP5Q14008 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CKAP5Q14008 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CKAP5Q14008 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CKAP5Q14008 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CKAP5Q14008 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CKAP5Q14008 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CKAP5Q14008 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CKAP5Q14008 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
CKAP5Q14008 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CKAP5Q14008 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CKAP5Q14008 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CKAP5Q14008 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CKAP5Q14008 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CKAP5Q14008 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CKAP5Q14008 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CKAP5Q14008 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CKAP5Q14008 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CKAP5Q14008 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CKAP5Q14008 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CKAP5Q14008 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CKAP5Q14008 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CKAP5Q14008 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CKAP5Q14008 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CKAP5Q14008 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
CKAP5Q14008 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CKAP5Q14008 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CKAP5Q14008 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CKAP5Q14008 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CKAP5Q14008 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CKAP5Q14008 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CKAP5Q14008 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CKAP5Q14008 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CKAP5Q14008 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
CKAP5Q14008 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CKAP5Q14008 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CKAP5Q14008 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CKAP5Q14008 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CKAP5Q14008 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CKAP5Q14008 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CKAP5Q14008 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CKAP5Q14008 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
CKAP5Q14008 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CKAP5Q14008 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CKAP5Q14008 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CKAP5Q14008 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CKAP5Q14008 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CKAP5Q14008 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CKAP5Q14008 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CKAP5Q14008 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CKAP5Q14008 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
CKAP5Q14008 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CKAP5Q14008 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
CKAP5Q14008 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CKAP5Q14008 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CKAP5Q14008 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CKAP5Q14008 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CKAP5Q14008 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CKAP5Q14008 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CKAP5Q14008 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CKAP5Q14008 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CKAP5Q14008 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CKAP5Q14008 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CKAP5Q14008 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CKAP5Q14008 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CKAP5Q14008 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CKAP5Q14008 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CKAP5Q14008 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CKAP5Q14008 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CKAP5Q14008 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CKAP5Q14008 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.9 ms