Protein–RNA interactions for Protein: Q13951

CBFB, Core-binding factor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBFBQ13951 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CBFBQ13951 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CBFBQ13951 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CBFBQ13951 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CBFBQ13951 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CBFBQ13951 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CBFBQ13951 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CBFBQ13951 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CBFBQ13951 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CBFBQ13951 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CBFBQ13951 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CBFBQ13951 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
CBFBQ13951 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CBFBQ13951 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CBFBQ13951 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CBFBQ13951 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CBFBQ13951 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
CBFBQ13951 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CBFBQ13951 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CBFBQ13951 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CBFBQ13951 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CBFBQ13951 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CBFBQ13951 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
CBFBQ13951 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CBFBQ13951 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CBFBQ13951 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CBFBQ13951 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CBFBQ13951 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CBFBQ13951 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CBFBQ13951 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CBFBQ13951 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CBFBQ13951 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CBFBQ13951 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CBFBQ13951 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CBFBQ13951 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CBFBQ13951 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CBFBQ13951 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CBFBQ13951 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CBFBQ13951 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CBFBQ13951 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CBFBQ13951 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CBFBQ13951 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CBFBQ13951 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CBFBQ13951 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CBFBQ13951 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CBFBQ13951 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CBFBQ13951 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CBFBQ13951 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CBFBQ13951 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CBFBQ13951 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CBFBQ13951 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CBFBQ13951 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CBFBQ13951 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
CBFBQ13951 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CBFBQ13951 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
CBFBQ13951 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CBFBQ13951 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CBFBQ13951 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CBFBQ13951 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CBFBQ13951 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CBFBQ13951 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CBFBQ13951 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CBFBQ13951 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CBFBQ13951 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CBFBQ13951 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CBFBQ13951 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CBFBQ13951 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CBFBQ13951 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CBFBQ13951 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CBFBQ13951 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CBFBQ13951 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CBFBQ13951 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CBFBQ13951 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CBFBQ13951 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CBFBQ13951 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CBFBQ13951 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CBFBQ13951 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CBFBQ13951 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CBFBQ13951 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CBFBQ13951 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CBFBQ13951 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
CBFBQ13951 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CBFBQ13951 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CBFBQ13951 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CBFBQ13951 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CBFBQ13951 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CBFBQ13951 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CBFBQ13951 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CBFBQ13951 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CBFBQ13951 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CBFBQ13951 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CBFBQ13951 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CBFBQ13951 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CBFBQ13951 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CBFBQ13951 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CBFBQ13951 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CBFBQ13951 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CBFBQ13951 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CBFBQ13951 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CBFBQ13951 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms