Protein–RNA interactions for Protein: Q13889

GTF2H3, General transcription factor IIH subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H3Q13889 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GTF2H3Q13889 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GTF2H3Q13889 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GTF2H3Q13889 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GTF2H3Q13889 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GTF2H3Q13889 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GTF2H3Q13889 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GTF2H3Q13889 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GTF2H3Q13889 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GTF2H3Q13889 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GTF2H3Q13889 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GTF2H3Q13889 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GTF2H3Q13889 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
GTF2H3Q13889 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
GTF2H3Q13889 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GTF2H3Q13889 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GTF2H3Q13889 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GTF2H3Q13889 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GTF2H3Q13889 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GTF2H3Q13889 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GTF2H3Q13889 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GTF2H3Q13889 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GTF2H3Q13889 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GTF2H3Q13889 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GTF2H3Q13889 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GTF2H3Q13889 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GTF2H3Q13889 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GTF2H3Q13889 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GTF2H3Q13889 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GTF2H3Q13889 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GTF2H3Q13889 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GTF2H3Q13889 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
GTF2H3Q13889 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
GTF2H3Q13889 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
GTF2H3Q13889 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GTF2H3Q13889 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GTF2H3Q13889 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GTF2H3Q13889 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GTF2H3Q13889 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GTF2H3Q13889 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GTF2H3Q13889 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GTF2H3Q13889 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GTF2H3Q13889 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GTF2H3Q13889 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GTF2H3Q13889 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GTF2H3Q13889 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GTF2H3Q13889 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
GTF2H3Q13889 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GTF2H3Q13889 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GTF2H3Q13889 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GTF2H3Q13889 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
GTF2H3Q13889 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GTF2H3Q13889 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GTF2H3Q13889 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
GTF2H3Q13889 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GTF2H3Q13889 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GTF2H3Q13889 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GTF2H3Q13889 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GTF2H3Q13889 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GTF2H3Q13889 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GTF2H3Q13889 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GTF2H3Q13889 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GTF2H3Q13889 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GTF2H3Q13889 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GTF2H3Q13889 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GTF2H3Q13889 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.83
GTF2H3Q13889 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GTF2H3Q13889 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GTF2H3Q13889 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
GTF2H3Q13889 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GTF2H3Q13889 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GTF2H3Q13889 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GTF2H3Q13889 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GTF2H3Q13889 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GTF2H3Q13889 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GTF2H3Q13889 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GTF2H3Q13889 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GTF2H3Q13889 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GTF2H3Q13889 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GTF2H3Q13889 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GTF2H3Q13889 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GTF2H3Q13889 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GTF2H3Q13889 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GTF2H3Q13889 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GTF2H3Q13889 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GTF2H3Q13889 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GTF2H3Q13889 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GTF2H3Q13889 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GTF2H3Q13889 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GTF2H3Q13889 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GTF2H3Q13889 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GTF2H3Q13889 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GTF2H3Q13889 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GTF2H3Q13889 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GTF2H3Q13889 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
GTF2H3Q13889 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GTF2H3Q13889 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GTF2H3Q13889 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GTF2H3Q13889 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GTF2H3Q13889 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.3 ms