Protein–RNA interactions for Protein: Q13797

ITGA9, Integrin alpha-9, humanhuman

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Length 1,035 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA9Q13797 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
ITGA9Q13797 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ITGA9Q13797 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ITGA9Q13797 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
ITGA9Q13797 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ITGA9Q13797 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ITGA9Q13797 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ITGA9Q13797 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
ITGA9Q13797 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ITGA9Q13797 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ITGA9Q13797 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ITGA9Q13797 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ITGA9Q13797 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ITGA9Q13797 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ITGA9Q13797 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ITGA9Q13797 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ITGA9Q13797 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ITGA9Q13797 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ITGA9Q13797 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ITGA9Q13797 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ITGA9Q13797 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ITGA9Q13797 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ITGA9Q13797 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ITGA9Q13797 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ITGA9Q13797 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
ITGA9Q13797 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ITGA9Q13797 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ITGA9Q13797 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
ITGA9Q13797 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.88
ITGA9Q13797 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ITGA9Q13797 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ITGA9Q13797 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
ITGA9Q13797 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ITGA9Q13797 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ITGA9Q13797 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ITGA9Q13797 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ITGA9Q13797 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ITGA9Q13797 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
ITGA9Q13797 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ITGA9Q13797 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
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ITGA9Q13797 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
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ITGA9Q13797 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ITGA9Q13797 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ITGA9Q13797 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ITGA9Q13797 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ITGA9Q13797 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
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ITGA9Q13797 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
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ITGA9Q13797 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
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ITGA9Q13797 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
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ITGA9Q13797 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
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ITGA9Q13797 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
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ITGA9Q13797 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ITGA9Q13797 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ITGA9Q13797 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ITGA9Q13797 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ITGA9Q13797 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ITGA9Q13797 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ITGA9Q13797 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ITGA9Q13797 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ITGA9Q13797 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ITGA9Q13797 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ITGA9Q13797 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ITGA9Q13797 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ITGA9Q13797 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ITGA9Q13797 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ITGA9Q13797 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ITGA9Q13797 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ITGA9Q13797 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ITGA9Q13797 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ITGA9Q13797 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ITGA9Q13797 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ITGA9Q13797 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
ITGA9Q13797 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ITGA9Q13797 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ITGA9Q13797 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
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