Protein–RNA interactions for Protein: Q13751

LAMB3, Laminin subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMB3Q13751 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
LAMB3Q13751 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
LAMB3Q13751 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
LAMB3Q13751 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
LAMB3Q13751 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
LAMB3Q13751 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
LAMB3Q13751 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
LAMB3Q13751 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
LAMB3Q13751 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
LAMB3Q13751 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
LAMB3Q13751 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
LAMB3Q13751 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
LAMB3Q13751 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
LAMB3Q13751 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
LAMB3Q13751 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
LAMB3Q13751 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
LAMB3Q13751 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
LAMB3Q13751 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
LAMB3Q13751 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
LAMB3Q13751 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
LAMB3Q13751 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
LAMB3Q13751 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
LAMB3Q13751 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
LAMB3Q13751 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
LAMB3Q13751 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
LAMB3Q13751 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
LAMB3Q13751 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.61■□□□□ 0.89
LAMB3Q13751 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
LAMB3Q13751 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
LAMB3Q13751 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
LAMB3Q13751 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
LAMB3Q13751 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
LAMB3Q13751 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
LAMB3Q13751 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
LAMB3Q13751 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
LAMB3Q13751 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
LAMB3Q13751 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
LAMB3Q13751 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
LAMB3Q13751 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
LAMB3Q13751 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
LAMB3Q13751 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
LAMB3Q13751 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
LAMB3Q13751 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
LAMB3Q13751 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
LAMB3Q13751 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
LAMB3Q13751 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
LAMB3Q13751 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
LAMB3Q13751 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
LAMB3Q13751 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
LAMB3Q13751 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
LAMB3Q13751 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
LAMB3Q13751 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
LAMB3Q13751 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LAMB3Q13751 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LAMB3Q13751 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
LAMB3Q13751 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
LAMB3Q13751 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
LAMB3Q13751 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC20.6■□□□□ 0.89
LAMB3Q13751 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LAMB3Q13751 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
LAMB3Q13751 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LAMB3Q13751 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LAMB3Q13751 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LAMB3Q13751 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
LAMB3Q13751 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LAMB3Q13751 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
LAMB3Q13751 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
LAMB3Q13751 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
LAMB3Q13751 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
LAMB3Q13751 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LAMB3Q13751 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
LAMB3Q13751 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LAMB3Q13751 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
LAMB3Q13751 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LAMB3Q13751 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
LAMB3Q13751 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
LAMB3Q13751 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
LAMB3Q13751 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LAMB3Q13751 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LAMB3Q13751 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
LAMB3Q13751 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LAMB3Q13751 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
LAMB3Q13751 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LAMB3Q13751 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
LAMB3Q13751 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LAMB3Q13751 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
LAMB3Q13751 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
LAMB3Q13751 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
LAMB3Q13751 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC20.59■□□□□ 0.89
LAMB3Q13751 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
LAMB3Q13751 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
LAMB3Q13751 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
LAMB3Q13751 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
LAMB3Q13751 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
LAMB3Q13751 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
LAMB3Q13751 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
LAMB3Q13751 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
LAMB3Q13751 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LAMB3Q13751 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
LAMB3Q13751 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms