Protein–RNA interactions for Protein: Q13568

IRF5, Interferon regulatory factor 5, humanhuman

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Length 498 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF5Q13568 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
IRF5Q13568 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
IRF5Q13568 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
IRF5Q13568 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
IRF5Q13568 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
IRF5Q13568 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
IRF5Q13568 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
IRF5Q13568 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
IRF5Q13568 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
IRF5Q13568 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
IRF5Q13568 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
IRF5Q13568 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
IRF5Q13568 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
IRF5Q13568 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
IRF5Q13568 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
IRF5Q13568 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
IRF5Q13568 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
IRF5Q13568 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
IRF5Q13568 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
IRF5Q13568 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
IRF5Q13568 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
IRF5Q13568 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
IRF5Q13568 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
IRF5Q13568 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
IRF5Q13568 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
IRF5Q13568 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
IRF5Q13568 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
IRF5Q13568 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
IRF5Q13568 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
IRF5Q13568 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
IRF5Q13568 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
IRF5Q13568 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
IRF5Q13568 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
IRF5Q13568 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
IRF5Q13568 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
IRF5Q13568 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
IRF5Q13568 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
IRF5Q13568 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
IRF5Q13568 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
IRF5Q13568 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
IRF5Q13568 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
IRF5Q13568 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
IRF5Q13568 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
IRF5Q13568 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
IRF5Q13568 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
IRF5Q13568 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
IRF5Q13568 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
IRF5Q13568 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
IRF5Q13568 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
IRF5Q13568 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
IRF5Q13568 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
IRF5Q13568 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
IRF5Q13568 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
IRF5Q13568 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
IRF5Q13568 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
IRF5Q13568 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
IRF5Q13568 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
IRF5Q13568 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
IRF5Q13568 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
IRF5Q13568 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
IRF5Q13568 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
IRF5Q13568 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
IRF5Q13568 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
IRF5Q13568 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
IRF5Q13568 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
IRF5Q13568 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
IRF5Q13568 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
IRF5Q13568 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
IRF5Q13568 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
IRF5Q13568 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
IRF5Q13568 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
IRF5Q13568 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
IRF5Q13568 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
IRF5Q13568 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
IRF5Q13568 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
IRF5Q13568 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
IRF5Q13568 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
IRF5Q13568 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
IRF5Q13568 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
IRF5Q13568 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
IRF5Q13568 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
IRF5Q13568 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
IRF5Q13568 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
IRF5Q13568 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
IRF5Q13568 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
IRF5Q13568 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
IRF5Q13568 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
IRF5Q13568 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
IRF5Q13568 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
IRF5Q13568 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
IRF5Q13568 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
IRF5Q13568 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
IRF5Q13568 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
IRF5Q13568 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
IRF5Q13568 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
IRF5Q13568 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
IRF5Q13568 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
IRF5Q13568 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
IRF5Q13568 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
IRF5Q13568 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
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