Protein–RNA interactions for Protein: Q13536

C1orf61, Protein CROC-4, humanhuman

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Length 156 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf61Q13536 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
C1orf61Q13536 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
C1orf61Q13536 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
C1orf61Q13536 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
C1orf61Q13536 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
C1orf61Q13536 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
C1orf61Q13536 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
C1orf61Q13536 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
C1orf61Q13536 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC19.92■□□□□ 0.78
C1orf61Q13536 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
C1orf61Q13536 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
C1orf61Q13536 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
C1orf61Q13536 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
C1orf61Q13536 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
C1orf61Q13536 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
C1orf61Q13536 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
C1orf61Q13536 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
C1orf61Q13536 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
C1orf61Q13536 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
C1orf61Q13536 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
C1orf61Q13536 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
C1orf61Q13536 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
C1orf61Q13536 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
C1orf61Q13536 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
C1orf61Q13536 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
C1orf61Q13536 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
C1orf61Q13536 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
C1orf61Q13536 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
C1orf61Q13536 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
C1orf61Q13536 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
C1orf61Q13536 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
C1orf61Q13536 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
C1orf61Q13536 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
C1orf61Q13536 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
C1orf61Q13536 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
C1orf61Q13536 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
C1orf61Q13536 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
C1orf61Q13536 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
C1orf61Q13536 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
C1orf61Q13536 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
C1orf61Q13536 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
C1orf61Q13536 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
C1orf61Q13536 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
C1orf61Q13536 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
C1orf61Q13536 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
C1orf61Q13536 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
C1orf61Q13536 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
C1orf61Q13536 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
C1orf61Q13536 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
C1orf61Q13536 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
C1orf61Q13536 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
C1orf61Q13536 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
C1orf61Q13536 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
C1orf61Q13536 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
C1orf61Q13536 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
C1orf61Q13536 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
C1orf61Q13536 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
C1orf61Q13536 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
C1orf61Q13536 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
C1orf61Q13536 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
C1orf61Q13536 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
C1orf61Q13536 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
C1orf61Q13536 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
C1orf61Q13536 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
C1orf61Q13536 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
C1orf61Q13536 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
C1orf61Q13536 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
C1orf61Q13536 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
C1orf61Q13536 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
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C1orf61Q13536 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
C1orf61Q13536 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
C1orf61Q13536 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
C1orf61Q13536 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
C1orf61Q13536 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
C1orf61Q13536 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
C1orf61Q13536 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
C1orf61Q13536 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
C1orf61Q13536 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
C1orf61Q13536 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
C1orf61Q13536 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
C1orf61Q13536 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
C1orf61Q13536 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
C1orf61Q13536 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
C1orf61Q13536 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
C1orf61Q13536 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
C1orf61Q13536 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
C1orf61Q13536 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
C1orf61Q13536 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
C1orf61Q13536 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
C1orf61Q13536 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
C1orf61Q13536 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
C1orf61Q13536 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
C1orf61Q13536 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
C1orf61Q13536 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
C1orf61Q13536 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
C1orf61Q13536 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
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