Protein–RNA interactions for Protein: Q13515

BFSP2, Phakinin, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BFSP2Q13515 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BFSP2Q13515 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
BFSP2Q13515 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BFSP2Q13515 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
BFSP2Q13515 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BFSP2Q13515 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BFSP2Q13515 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BFSP2Q13515 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BFSP2Q13515 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BFSP2Q13515 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BFSP2Q13515 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BFSP2Q13515 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BFSP2Q13515 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BFSP2Q13515 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BFSP2Q13515 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BFSP2Q13515 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BFSP2Q13515 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BFSP2Q13515 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BFSP2Q13515 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BFSP2Q13515 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BFSP2Q13515 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BFSP2Q13515 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BFSP2Q13515 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BFSP2Q13515 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BFSP2Q13515 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BFSP2Q13515 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
BFSP2Q13515 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BFSP2Q13515 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BFSP2Q13515 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BFSP2Q13515 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BFSP2Q13515 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BFSP2Q13515 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BFSP2Q13515 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BFSP2Q13515 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BFSP2Q13515 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BFSP2Q13515 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BFSP2Q13515 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BFSP2Q13515 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BFSP2Q13515 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BFSP2Q13515 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
BFSP2Q13515 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BFSP2Q13515 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BFSP2Q13515 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BFSP2Q13515 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
BFSP2Q13515 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
BFSP2Q13515 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
BFSP2Q13515 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
BFSP2Q13515 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
BFSP2Q13515 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
BFSP2Q13515 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
BFSP2Q13515 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
BFSP2Q13515 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
BFSP2Q13515 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
BFSP2Q13515 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
BFSP2Q13515 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BFSP2Q13515 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BFSP2Q13515 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BFSP2Q13515 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BFSP2Q13515 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BFSP2Q13515 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
BFSP2Q13515 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
BFSP2Q13515 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
BFSP2Q13515 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
BFSP2Q13515 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
BFSP2Q13515 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
BFSP2Q13515 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BFSP2Q13515 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
BFSP2Q13515 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
BFSP2Q13515 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BFSP2Q13515 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BFSP2Q13515 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BFSP2Q13515 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BFSP2Q13515 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BFSP2Q13515 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
BFSP2Q13515 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BFSP2Q13515 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BFSP2Q13515 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BFSP2Q13515 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
BFSP2Q13515 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
BFSP2Q13515 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
BFSP2Q13515 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
BFSP2Q13515 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
BFSP2Q13515 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
BFSP2Q13515 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BFSP2Q13515 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BFSP2Q13515 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BFSP2Q13515 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
BFSP2Q13515 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
BFSP2Q13515 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BFSP2Q13515 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BFSP2Q13515 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BFSP2Q13515 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
BFSP2Q13515 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
BFSP2Q13515 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BFSP2Q13515 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
BFSP2Q13515 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
BFSP2Q13515 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
BFSP2Q13515 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
BFSP2Q13515 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BFSP2Q13515 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
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