Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MKRN4PQ13434 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MKRN4PQ13434 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MKRN4PQ13434 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MKRN4PQ13434 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MKRN4PQ13434 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MKRN4PQ13434 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MKRN4PQ13434 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MKRN4PQ13434 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MKRN4PQ13434 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MKRN4PQ13434 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MKRN4PQ13434 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
MKRN4PQ13434 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MKRN4PQ13434 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MKRN4PQ13434 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MKRN4PQ13434 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MKRN4PQ13434 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MKRN4PQ13434 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MKRN4PQ13434 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MKRN4PQ13434 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MKRN4PQ13434 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MKRN4PQ13434 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MKRN4PQ13434 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MKRN4PQ13434 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MKRN4PQ13434 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MKRN4PQ13434 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MKRN4PQ13434 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MKRN4PQ13434 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MKRN4PQ13434 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MKRN4PQ13434 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MKRN4PQ13434 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MKRN4PQ13434 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MKRN4PQ13434 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MKRN4PQ13434 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MKRN4PQ13434 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MKRN4PQ13434 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MKRN4PQ13434 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MKRN4PQ13434 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MKRN4PQ13434 AC026790.2-201ENST00000606282 430 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
MKRN4PQ13434 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
MKRN4PQ13434 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MKRN4PQ13434 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MKRN4PQ13434 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MKRN4PQ13434 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MKRN4PQ13434 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MKRN4PQ13434 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MKRN4PQ13434 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MKRN4PQ13434 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MKRN4PQ13434 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MKRN4PQ13434 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MKRN4PQ13434 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MKRN4PQ13434 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MKRN4PQ13434 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MKRN4PQ13434 OR2J1-201ENST00000377171 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MKRN4PQ13434 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MKRN4PQ13434 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MKRN4PQ13434 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MKRN4PQ13434 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MKRN4PQ13434 AP000240.1-201ENST00000609910 452 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
MKRN4PQ13434 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MKRN4PQ13434 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MKRN4PQ13434 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MKRN4PQ13434 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MKRN4PQ13434 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
MKRN4PQ13434 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MKRN4PQ13434 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MKRN4PQ13434 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MKRN4PQ13434 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
MKRN4PQ13434 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MKRN4PQ13434 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MKRN4PQ13434 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MKRN4PQ13434 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MKRN4PQ13434 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MKRN4PQ13434 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MKRN4PQ13434 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MKRN4PQ13434 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MKRN4PQ13434 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MKRN4PQ13434 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MKRN4PQ13434 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MKRN4PQ13434 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MKRN4PQ13434 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MKRN4PQ13434 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MKRN4PQ13434 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MKRN4PQ13434 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MKRN4PQ13434 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MKRN4PQ13434 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MKRN4PQ13434 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MKRN4PQ13434 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MKRN4PQ13434 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MKRN4PQ13434 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MKRN4PQ13434 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MKRN4PQ13434 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MKRN4PQ13434 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MKRN4PQ13434 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MKRN4PQ13434 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MKRN4PQ13434 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MKRN4PQ13434 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MKRN4PQ13434 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MKRN4PQ13434 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MKRN4PQ13434 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
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