Protein–RNA interactions for Protein: Q13352

ITGB3BP, Centromere protein R, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3BPQ13352 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ITGB3BPQ13352 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ITGB3BPQ13352 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ITGB3BPQ13352 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ITGB3BPQ13352 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ITGB3BPQ13352 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ITGB3BPQ13352 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ITGB3BPQ13352 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ITGB3BPQ13352 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ITGB3BPQ13352 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ITGB3BPQ13352 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ITGB3BPQ13352 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ITGB3BPQ13352 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
ITGB3BPQ13352 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ITGB3BPQ13352 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
ITGB3BPQ13352 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ITGB3BPQ13352 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ITGB3BPQ13352 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ITGB3BPQ13352 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ITGB3BPQ13352 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ITGB3BPQ13352 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ITGB3BPQ13352 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ITGB3BPQ13352 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ITGB3BPQ13352 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ITGB3BPQ13352 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ITGB3BPQ13352 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ITGB3BPQ13352 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ITGB3BPQ13352 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ITGB3BPQ13352 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ITGB3BPQ13352 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ITGB3BPQ13352 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ITGB3BPQ13352 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
ITGB3BPQ13352 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ITGB3BPQ13352 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ITGB3BPQ13352 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ITGB3BPQ13352 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ITGB3BPQ13352 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ITGB3BPQ13352 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ITGB3BPQ13352 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ITGB3BPQ13352 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ITGB3BPQ13352 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ITGB3BPQ13352 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
ITGB3BPQ13352 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ITGB3BPQ13352 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ITGB3BPQ13352 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ITGB3BPQ13352 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ITGB3BPQ13352 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ITGB3BPQ13352 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ITGB3BPQ13352 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ITGB3BPQ13352 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ITGB3BPQ13352 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ITGB3BPQ13352 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ITGB3BPQ13352 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ITGB3BPQ13352 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ITGB3BPQ13352 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ITGB3BPQ13352 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ITGB3BPQ13352 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ITGB3BPQ13352 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ITGB3BPQ13352 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
ITGB3BPQ13352 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ITGB3BPQ13352 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ITGB3BPQ13352 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ITGB3BPQ13352 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ITGB3BPQ13352 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ITGB3BPQ13352 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ITGB3BPQ13352 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ITGB3BPQ13352 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ITGB3BPQ13352 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ITGB3BPQ13352 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ITGB3BPQ13352 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ITGB3BPQ13352 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ITGB3BPQ13352 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ITGB3BPQ13352 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ITGB3BPQ13352 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ITGB3BPQ13352 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ITGB3BPQ13352 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ITGB3BPQ13352 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ITGB3BPQ13352 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ITGB3BPQ13352 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ITGB3BPQ13352 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ITGB3BPQ13352 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ITGB3BPQ13352 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
ITGB3BPQ13352 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ITGB3BPQ13352 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ITGB3BPQ13352 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ITGB3BPQ13352 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ITGB3BPQ13352 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
ITGB3BPQ13352 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ITGB3BPQ13352 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
ITGB3BPQ13352 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ITGB3BPQ13352 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ITGB3BPQ13352 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ITGB3BPQ13352 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ITGB3BPQ13352 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ITGB3BPQ13352 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ITGB3BPQ13352 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
ITGB3BPQ13352 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
ITGB3BPQ13352 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ITGB3BPQ13352 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ITGB3BPQ13352 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms