Protein–RNA interactions for Protein: Q13326

SGCG, Gamma-sarcoglycan, humanhuman

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Length 291 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCGQ13326 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SGCGQ13326 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SGCGQ13326 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
SGCGQ13326 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SGCGQ13326 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
SGCGQ13326 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
SGCGQ13326 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
SGCGQ13326 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SGCGQ13326 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
SGCGQ13326 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SGCGQ13326 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SGCGQ13326 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SGCGQ13326 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SGCGQ13326 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SGCGQ13326 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SGCGQ13326 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SGCGQ13326 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SGCGQ13326 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SGCGQ13326 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SGCGQ13326 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SGCGQ13326 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
SGCGQ13326 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SGCGQ13326 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SGCGQ13326 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SGCGQ13326 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SGCGQ13326 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SGCGQ13326 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SGCGQ13326 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SGCGQ13326 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SGCGQ13326 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SGCGQ13326 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SGCGQ13326 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SGCGQ13326 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SGCGQ13326 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SGCGQ13326 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SGCGQ13326 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SGCGQ13326 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SGCGQ13326 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SGCGQ13326 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SGCGQ13326 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SGCGQ13326 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SGCGQ13326 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SGCGQ13326 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SGCGQ13326 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SGCGQ13326 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SGCGQ13326 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SGCGQ13326 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SGCGQ13326 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SGCGQ13326 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SGCGQ13326 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SGCGQ13326 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SGCGQ13326 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SGCGQ13326 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SGCGQ13326 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SGCGQ13326 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
SGCGQ13326 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SGCGQ13326 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SGCGQ13326 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SGCGQ13326 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
SGCGQ13326 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SGCGQ13326 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SGCGQ13326 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SGCGQ13326 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SGCGQ13326 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SGCGQ13326 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SGCGQ13326 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SGCGQ13326 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SGCGQ13326 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SGCGQ13326 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SGCGQ13326 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SGCGQ13326 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SGCGQ13326 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SGCGQ13326 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
SGCGQ13326 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SGCGQ13326 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SGCGQ13326 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SGCGQ13326 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SGCGQ13326 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
SGCGQ13326 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SGCGQ13326 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SGCGQ13326 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
SGCGQ13326 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SGCGQ13326 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SGCGQ13326 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SGCGQ13326 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SGCGQ13326 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SGCGQ13326 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SGCGQ13326 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SGCGQ13326 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SGCGQ13326 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SGCGQ13326 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SGCGQ13326 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SGCGQ13326 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SGCGQ13326 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SGCGQ13326 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SGCGQ13326 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SGCGQ13326 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SGCGQ13326 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SGCGQ13326 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SGCGQ13326 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
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