Protein–RNA interactions for Protein: Q13185

CBX3, Chromobox protein homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX3Q13185 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CBX3Q13185 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CBX3Q13185 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CBX3Q13185 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CBX3Q13185 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CBX3Q13185 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CBX3Q13185 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CBX3Q13185 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CBX3Q13185 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CBX3Q13185 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CBX3Q13185 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CBX3Q13185 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CBX3Q13185 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CBX3Q13185 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CBX3Q13185 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CBX3Q13185 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CBX3Q13185 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CBX3Q13185 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CBX3Q13185 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CBX3Q13185 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CBX3Q13185 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CBX3Q13185 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CBX3Q13185 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CBX3Q13185 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CBX3Q13185 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CBX3Q13185 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CBX3Q13185 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CBX3Q13185 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CBX3Q13185 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CBX3Q13185 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CBX3Q13185 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CBX3Q13185 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CBX3Q13185 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CBX3Q13185 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CBX3Q13185 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CBX3Q13185 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CBX3Q13185 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CBX3Q13185 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CBX3Q13185 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CBX3Q13185 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CBX3Q13185 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CBX3Q13185 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CBX3Q13185 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CBX3Q13185 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CBX3Q13185 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CBX3Q13185 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CBX3Q13185 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CBX3Q13185 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CBX3Q13185 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CBX3Q13185 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CBX3Q13185 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CBX3Q13185 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CBX3Q13185 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CBX3Q13185 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CBX3Q13185 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CBX3Q13185 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CBX3Q13185 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CBX3Q13185 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CBX3Q13185 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CBX3Q13185 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CBX3Q13185 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CBX3Q13185 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CBX3Q13185 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CBX3Q13185 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CBX3Q13185 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CBX3Q13185 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CBX3Q13185 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CBX3Q13185 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CBX3Q13185 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CBX3Q13185 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CBX3Q13185 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CBX3Q13185 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CBX3Q13185 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CBX3Q13185 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CBX3Q13185 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CBX3Q13185 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CBX3Q13185 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CBX3Q13185 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CBX3Q13185 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CBX3Q13185 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CBX3Q13185 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CBX3Q13185 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CBX3Q13185 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CBX3Q13185 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CBX3Q13185 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CBX3Q13185 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CBX3Q13185 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CBX3Q13185 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CBX3Q13185 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CBX3Q13185 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CBX3Q13185 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CBX3Q13185 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CBX3Q13185 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CBX3Q13185 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CBX3Q13185 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CBX3Q13185 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CBX3Q13185 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CBX3Q13185 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CBX3Q13185 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CBX3Q13185 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms